97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4341 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  100 
 
 
294 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  80.14 
 
 
288 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  72.13 
 
 
288 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  73.67 
 
 
287 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  73.67 
 
 
287 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  73.67 
 
 
287 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  73.14 
 
 
287 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  73.55 
 
 
276 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  73.19 
 
 
276 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  73.36 
 
 
276 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  72.83 
 
 
276 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  70.04 
 
 
279 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  67.83 
 
 
289 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  69.01 
 
 
287 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  70.29 
 
 
276 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  64.56 
 
 
288 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  39.58 
 
 
291 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  34.88 
 
 
298 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  36.12 
 
 
297 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  38.35 
 
 
286 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  32.89 
 
 
305 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  38.28 
 
 
288 aa  175  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  35.44 
 
 
297 aa  175  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  35.76 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  34.05 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  34.11 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
284 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  33.7 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  38.62 
 
 
267 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  34.86 
 
 
285 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  35.16 
 
 
280 aa  156  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  32.31 
 
 
311 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  35.21 
 
 
285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  32.7 
 
 
285 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  32.98 
 
 
306 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  35.92 
 
 
314 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  33.11 
 
 
305 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  32.16 
 
 
292 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  31.16 
 
 
284 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  32.5 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  32.99 
 
 
286 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  31.25 
 
 
320 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  31.23 
 
 
301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  32.1 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  32.64 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  34.9 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  32.33 
 
 
317 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  28.78 
 
 
285 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  30.8 
 
 
333 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  30.68 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  30.68 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  28.68 
 
 
300 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  31.71 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  32.38 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  29.04 
 
 
339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  32.46 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  30.3 
 
 
281 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  27.72 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  28.29 
 
 
335 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  27.76 
 
 
284 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  30.89 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  29.85 
 
 
311 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  28.09 
 
 
297 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  26.89 
 
 
282 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  26.56 
 
 
280 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  25.94 
 
 
291 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  31.47 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  26.55 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  24.44 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  22.27 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  23.85 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0535  putative signal peptide protein  32.97 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.186468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  25.28 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  38.24 
 
 
142 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  33.02 
 
 
144 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  34.67 
 
 
141 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  34.07 
 
 
127 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  31.52 
 
 
142 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  34.67 
 
 
157 aa  45.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  36.49 
 
 
352 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  33.82 
 
 
141 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  34.67 
 
 
138 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  31.03 
 
 
150 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  34.29 
 
 
142 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  33.75 
 
 
137 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  35.29 
 
 
142 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.67 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  34.38 
 
 
155 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  30 
 
 
142 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  37.66 
 
 
142 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  46.81 
 
 
138 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  43.18 
 
 
133 aa  42.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  46.81 
 
 
138 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  46.81 
 
 
138 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  31.58 
 
 
144 aa  42.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  35.29 
 
 
130 aa  42.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  35.29 
 
 
130 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>