244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2428 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  169  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  56.96 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  56.96 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  60.53 
 
 
80 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.16284e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  53.25 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.26 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.65 
 
 
103 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  51.9 
 
 
82 aa  90.1  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.65 
 
 
103 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  58.67 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.32 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  58.67 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  49.35 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.26 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  56.58 
 
 
88 aa  86.7  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.81458e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  49.4 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  55.26 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  53.95 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.05 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.22957e-08  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.05 
 
 
77 aa  83.6  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 
91 aa  83.2  1e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.68 
 
 
130 aa  82.8  1e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.1 
 
 
84 aa  82  2e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.35 
 
 
80 aa  81.6  3e-15  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  53.95 
 
 
88 aa  81.3  4e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.65 
 
 
88 aa  80.9  5e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.59134e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 
80 aa  80.9  5e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.9981e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  46.84 
 
 
163 aa  80.9  6e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  47.44 
 
 
90 aa  80.9  6e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  48.75 
 
 
338 aa  80.1  8e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.66383e-11  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  49.33 
 
 
89 aa  78.6  3e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  48.72 
 
 
106 aa  78.2  4e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  45.57 
 
 
167 aa  77.8  4e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 
86 aa  77.8  5e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  45.78 
 
 
119 aa  77.8  5e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 
92 aa  77.4  6e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  44.3 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.05 
 
 
93 aa  77.4  7e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  44.3 
 
 
141 aa  76.6  9e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.3 
 
 
166 aa  77  9e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  46.99 
 
 
87 aa  76.3  1e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  44.16 
 
 
95 aa  76.3  1e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 
84 aa  76.3  1e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  43.75 
 
 
122 aa  75.9  2e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 
147 aa  75.5  2e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 
140 aa  75.1  3e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.45 
 
 
93 aa  75.1  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  48.68 
 
 
86 aa  74.7  4e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  52 
 
 
93 aa  74.7  4e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 
180 aa  74.3  5e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4258  excinuclease ABC subunit C  47.5 
 
 
100 aa  74.3  5e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00754458  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  52.7 
 
 
79 aa  74.3  5e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  46.25 
 
 
104 aa  73.9  6e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 
95 aa  74.3  6e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  1.28421e-08 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.67 
 
 
151 aa  73.9  7e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  41.98 
 
 
90 aa  73.6  9e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 
117 aa  73.6  9e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  43.42 
 
 
116 aa  73.6  9e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 
108 aa  73.2  1e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.27 
 
 
105 aa  73.2  1e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.71 
 
 
96 aa  73.2  1e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  42.67 
 
 
165 aa  72  2e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  44.12 
 
 
284 aa  72.4  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 
97 aa  71.6  3e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  44.12 
 
 
264 aa  72  3e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  44.12 
 
 
322 aa  72  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  44.12 
 
 
334 aa  72  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.71 
 
 
96 aa  71.6  3e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  44.12 
 
 
304 aa  72  3e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  44.12 
 
 
298 aa  72  3e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.11 
 
 
109 aa  71.6  3e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1608  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.65 
 
 
91 aa  71.6  4e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3649  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.05 
 
 
131 aa  71.2  4e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 
96 aa  71.6  4e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.27073e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 
107 aa  70.9  6e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.06 
 
 
96 aa  70.5  7e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  41.25 
 
 
100 aa  70.5  8e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  42.67 
 
 
110 aa  70.5  8e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  9.51078e-06 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.44 
 
 
104 aa  70.5  8e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 
121 aa  70.1  1e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  46.15 
 
 
98 aa  69.7  1e-11  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.24 
 
 
93 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 
88 aa  68.9  2e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.29 
 
 
96 aa  69.3  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 
117 aa  68.9  2e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.29 
 
 
96 aa  69.3  2e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.29 
 
 
96 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  43.04 
 
 
94 aa  69.3  2e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.29 
 
 
96 aa  69.3  2e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  44.16 
 
 
137 aa  68.6  2e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.29 
 
 
96 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.27 
 
 
86 aa  68.9  2e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.33 
 
 
97 aa  68.6  3e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 
91 aa  68.2  3e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3525  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.05 
 
 
143 aa  68.2  4e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.506874  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3763  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 
101 aa  67.8  4e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 
107 aa  66.2  1e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.26 
 
 
100 aa  66.6  1e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1200  URI-like endonuclease  44.59 
 
 
90 aa  65.9  2e-10  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  42.47 
 
 
87 aa  66.2  2e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>