177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2126 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 
105 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  56.99 
 
 
117 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  54.05 
 
 
291 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  61.76 
 
 
84 aa  94.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  54.05 
 
 
296 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  61.11 
 
 
80 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  48.86 
 
 
285 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  52.7 
 
 
289 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  48.86 
 
 
295 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 
237 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  48.86 
 
 
299 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  46.15 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.65 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  47.22 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  48.65 
 
 
284 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  48.65 
 
 
264 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  48.65 
 
 
298 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  48.65 
 
 
304 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  48.65 
 
 
334 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  48.65 
 
 
322 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  50 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  46.99 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.68 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  41.05 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.59 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  43.68 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.3 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  45.24 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  48.44 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.44 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.04 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.04 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.04 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.04 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.04 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.3 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1608  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.28 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.71 
 
 
93 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.3 
 
 
77 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  49.32 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.61 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.57 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  37.36 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02157  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.22 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  53.73 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0972  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.74 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.4 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  39.29 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.35 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  48.53 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.4 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.51 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  42.67 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  50.65 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1011  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.48 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  48.44 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  38.67 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  38.67 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  46.27 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2824  excinuclease ABC subunit C  50.62 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.58 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  38.1 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.59 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.98 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1080  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.93 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984225  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.59 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.59 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0979  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.51 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888476  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.24 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000538  excinuclease ABC C subunit  36.49 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.559483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4244  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.02 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.89 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  42.25 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  42.25 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.51 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.71 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  43.24 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.95 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  42.47 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  38.96 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.73 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.19 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.16 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  40 
 
 
338 aa  67.8  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.19 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  46.15 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.19 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>