213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0133 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
119 aa  247  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  79.27 
 
 
166 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  80.49 
 
 
163 aa  146  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  75.61 
 
 
167 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  77.11 
 
 
92 aa  141  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  77.5 
 
 
139 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  77.5 
 
 
141 aa  140  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  77.5 
 
 
140 aa  140  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  75 
 
 
147 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  68.67 
 
 
84 aa  133  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  74.36 
 
 
122 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  69.14 
 
 
90 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  66.27 
 
 
95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  63.95 
 
 
97 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  63.41 
 
 
107 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  63.75 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2327  excinuclease ABC subunit C  59.76 
 
 
99 aa  100  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.418538  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.61 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50.54 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50.54 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50.54 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2824  excinuclease ABC subunit C  55.13 
 
 
92 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50.54 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.22 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.32 
 
 
100 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  54.32 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.38 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.32 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.32 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.32 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  54.32 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.32 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.32 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  56.25 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  54.32 
 
 
101 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.09 
 
 
100 aa  87  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.44 
 
 
95 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.44 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1452  excinuclease ABC subunit C  49.38 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00178124  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.44 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.19 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  48.28 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  48.78 
 
 
90 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  47.44 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.56 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.78 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0507  excinuclease ABC subunit C  50.63 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3600  excinuclease ABC subunit C  43.21 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  43.82 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  44.71 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  45.78 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.96 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.96 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.75 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.75 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.57 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.3 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0980  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.38 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11350  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.53 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651931  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  43.9 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  48.05 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.59 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.96 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  48.65 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  40.2 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  38.55 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.86 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.45 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  38.55 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.93 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02607  hypothetical URI domain endonuclease  45 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  42.86 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000538  excinuclease ABC C subunit  37.36 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.559483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.02 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  41.56 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  41.77 
 
 
289 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  41.56 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  36.71 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1262  endo/excinuclease domain protein  43.75 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.505421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  41.77 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  35.92 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4244  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.25 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1080  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.25 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984225  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.75 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  41.77 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  41.77 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  39.24 
 
 
284 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
296 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  39.24 
 
 
298 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  39.24 
 
 
322 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>