165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1200 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1200  URI-like endonuclease  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221848  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  61.54 
 
 		 330 aa  104  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  62.65 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  52.5 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  51.25 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  51.25 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.56 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  50.6 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.59 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.21 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.05 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.74 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.59 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.03 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.59 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.74 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  44.74 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  44.87 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.89 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.42 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.42 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.42 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.42 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.42 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  43.21 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.88 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  44.94 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.24 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.59 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.59 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  44.59 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  41.67 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.07 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  43.84 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1262  endo/excinuclease domain protein  41.56 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.505421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.68 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  42.47 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  41.89 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.74 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  33.33 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.04 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.54 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.04 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.04 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1080  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.96 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.27 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.27 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.04 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.12 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  41.33 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  40.79 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.74 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  40.54 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  43.42 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  39.08 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  40.48 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  39.19 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  40.79 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.51 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.78 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4244  GIY-YIG nuclease superfamily protein  35.9 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0980  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.66 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11350  GIY-YIG nuclease superfamily protein  35.06 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0507  excinuclease ABC subunit C  37.65 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  39.51 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0972  GIY-YIG nuclease superfamily protein  33.77 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  40.54 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  39.51 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.51 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.74 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1257  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.48 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.51 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.51 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.74 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.51 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  43.66 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  35.63 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.51 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.51 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.76 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  37.21 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  32.43 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>