230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1952 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  89.87 
 
 
84 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  74.67 
 
 
77 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  75 
 
 
80 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  68.97 
 
 
91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  67.53 
 
 
86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  61.84 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  57.89 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  57.89 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  55.13 
 
 
82 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  58.11 
 
 
97 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  58.11 
 
 
96 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.25 
 
 
80 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  56.76 
 
 
100 aa  94  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  60.81 
 
 
121 aa  94  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.68 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.56 
 
 
96 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  62.16 
 
 
94 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.67 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.67 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.67 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.67 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.67 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  53.33 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  50.63 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  54.22 
 
 
87 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.32 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.32 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  51.81 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  53.33 
 
 
96 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  56.76 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  55.71 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  48.75 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  54.05 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  57.89 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  56.58 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.26 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  48.68 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  45.45 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  51.25 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.67 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.41 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  53.62 
 
 
87 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  53.62 
 
 
87 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  52.7 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  42.68 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0507  excinuclease ABC subunit C  48.19 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  52.7 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  49.32 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.37 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  48.65 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  48.65 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  48.65 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  46.05 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.35 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  46.05 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.34 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 
95 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  42.68 
 
 
96 aa  77  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  49.32 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  44.87 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  46.05 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.05 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  46.05 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  46.58 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  46.05 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.05 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.42 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.48 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.37 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.3 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.3 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.3 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.3 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.3 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  42.17 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  46.67 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3661  excinuclease ABC subunit C  51.95 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.902012  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.89 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  47.89 
 
 
80 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  44.74 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  43.42 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  46.67 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  46.67 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  46.67 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  46.67 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>