153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3625 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  100 
 
 		 120 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  99.17 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  99.17 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  99.17 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  99.17 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  81 
 
 		 100 aa  170  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  81 
 
 		 100 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  81 
 
 		 100 aa  169  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  81 
 
 		 100 aa  169  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  81 
 
 		 100 aa  169  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  81 
 
 		 100 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  81 
 
 		 100 aa  169  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  81 
 
 		 100 aa  169  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  80 
 
 		 100 aa  167  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  69.03 
 
 		 113 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  69.62 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  69.62 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  69.62 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  67.86 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  72.15 
 
 		 99 aa  120  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0507  excinuclease ABC subunit C  60.22 
 
 		 117 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  56.7 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  61.25 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  60.24 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  52.17 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000538  excinuclease ABC C subunit  55.17 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.559483  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  58.97 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  57.69 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2824  excinuclease ABC subunit C  56.41 
 
 		 92 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.88 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  58.97 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  57.32 
 
 		 140 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  55.68 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  54.32 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2327  excinuclease ABC subunit C  56.1 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.418538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  55.13 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  55.56 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  55.13 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  53.57 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  45.92 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  55 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  44.79 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  43.18 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  46.51 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  42.53 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1452  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00178124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.24 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.57 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  41.57 
 
 		 296 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  42.7 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  41.57 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  41.57 
 
 		 289 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  41.77 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.3 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.3 
 
 		 77 aa  73.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  42.05 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 295 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.33 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 299 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  42.05 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  42.05 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  42.05 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  44.87 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  43.42 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.67 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 285 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  42.05 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  42.05 
 
 		 284 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3600  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1262  endo/excinuclease domain protein  37.76 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.505421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  45.33 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0972  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.03 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1080  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.24 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.03 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11350  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.9 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1011  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.17 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02607  hypothetical URI domain endonuclease  42.68 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.97 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  39.78 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  39.8 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0980  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.26 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4244  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.03 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.59 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  42.17 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.05 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  33.66 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1257  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.56 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0979  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.74 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0247  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.67 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.73 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.05 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  41.03 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14150  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.26 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121781  normal  0.153151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  43.06 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  38.27 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>