227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1435 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.26 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.22 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.01 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.56 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  46.34 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.05 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.05 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.75 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  48.68 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  48.1 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  51.9 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  51.9 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.75 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.25 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  53.95 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.05 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  56.16 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.84 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.1 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  47.3 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  51.35 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  48.72 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  48.72 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  51.28 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.46 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  48.1 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  45.45 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  44.05 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.18 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.37 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  42.86 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  43.75 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  43.37 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.18 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  43.53 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  43.75 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  41.98 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.02 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.24 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.24 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.24 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.24 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  47.44 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.24 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  46.91 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  42.67 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  39.29 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.24 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.75 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  42.11 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  42.11 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  41.25 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.66 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.25 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.79 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.66 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  38.46 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  42.11 
 
 		 338 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  43.21 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14150  GIY-YIG nuclease superfamily protein  33.72 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121781  normal  0.153151 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.62 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11350  GIY-YIG nuclease superfamily protein  35.44 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651931  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1080  GIY-YIG nuclease superfamily protein  35.9 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.984225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  41.98 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  34.18 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1257  GIY-YIG nuclease superfamily protein  32.56 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.5 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02157  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.84 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.26 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  36.14 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1009  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.62 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1452  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00178124  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0979  GIY-YIG nuclease superfamily protein  31.71 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  36.14 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1011  GIY-YIG nuclease superfamily protein  33.33 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  48.05 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  39.47 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4244  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.62 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>