170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0682 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 96 aa  199  9e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1200  URI-like endonuclease  62.65 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221848  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  54.43 
 
 		 330 aa  94  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  54.12 
 
 		 338 aa  92  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  51.25 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  48.78 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  46.99 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  43.37 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.72 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  46.34 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  45.78 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.78 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.78 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.37 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000538  excinuclease ABC C subunit  44.87 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.559483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.68 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.35 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.78 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.78 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.78 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.78 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.3 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.78 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.31 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.3 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.17 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.58 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  43.21 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  40.45 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  39.08 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.91 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.59 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  40.51 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.25 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  38.75 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.65 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.75 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.08 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  41.89 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.77 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.27 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.74 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.74 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.74 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0247  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.26 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.74 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.74 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  38.75 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  38.75 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.75 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.75 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  41.56 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  40.86 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.75 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.75 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.27 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.44 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  38.96 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  39.02 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1608  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.2 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.5 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  38.37 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  40.79 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  37.97 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  37.97 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  40.79 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  38.55 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  37.66 
 
 		 284 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  40.48 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  38.96 
 
 		 298 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02157  GIY-YIG nuclease superfamily protein  32.95 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  38.96 
 
 		 304 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  38.96 
 
 		 334 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  38.96 
 
 		 322 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  40.51 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  40.79 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  36.49 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.96 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.15 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  39.76 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  34.88 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.15 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  31.87 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>