228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2257 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 		 91 aa  189  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  78.48 
 
 		 80 aa  132  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  74.68 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  68.6 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  72.97 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  60 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  57.5 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  54.43 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  54.43 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.84 
 
 		 80 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.95 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  55.7 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  58.23 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  51.95 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  55 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  51.95 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  51.95 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.43 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  57.69 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  56.34 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  53.52 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.38 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  49.35 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.19 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  51.35 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.26 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  48.15 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  53.95 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.24 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  52.63 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  54.67 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  50.68 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  42.35 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  51.32 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  44.3 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  47.44 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.15 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.15 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.15 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.15 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.37 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.15 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.37 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.45 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  45.57 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  45.57 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  43.42 
 
 		 338 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.78 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  50 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  44.87 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.83 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.67 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  44.87 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.83 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.83 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  44.87 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.67 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.67 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.67 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.67 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  45.07 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.67 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1200  URI-like endonuclease  43.59 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  44.44 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.95 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  40.51 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.16 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 285 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  39.29 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 295 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  43.21 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 299 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.68 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.74 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.68 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.68 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.29 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.67 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  41.98 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.74 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  43.42 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3661  excinuclease ABC subunit C  43.68 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.902012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  40.79 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>