151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2420 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 285 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  91.86 
 
 		 295 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  90.64 
 
 		 299 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  69.8 
 
 		 291 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  71 
 
 		 296 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  64.38 
 
 		 289 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  87.64 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  86.52 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  86.52 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  86.52 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  86.52 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  86.52 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  76.67 
 
 		 109 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  76.14 
 
 		 116 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  79.78 
 
 		 165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  77.53 
 
 		 110 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  57.5 
 
 		 86 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  55.7 
 
 		 90 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.7 
 
 		 105 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  48.78 
 
 		 98 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  62.12 
 
 		 88 aa  86.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.41 
 
 		 84 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.65 
 
 		 93 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  53.62 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.95 
 
 		 100 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.95 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.95 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  51.95 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.95 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  51.95 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.95 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.95 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  51.95 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02157  GIY-YIG nuclease superfamily protein  54.17 
 
 		 101 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 		 117 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  43.82 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  46.25 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  44.32 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  44.71 
 
 		 147 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2194  excinuclease ABC subunit C  49.33 
 
 		 96 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  44.3 
 
 		 151 aa  75.5  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0247  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.02 
 
 		 127 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  46.75 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.02 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.02 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.02 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.02 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  41.25 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.05 
 
 		 93 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  37.36 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  40.51 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  45.45 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.86 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  49.37 
 
 		 89 aa  72  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  48.05 
 
 		 107 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  47.83 
 
 		 106 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.05 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.33 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  48.33 
 
 		 88 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.86 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  46.75 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3453  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.74 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.472079  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.58 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  50.79 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.56 
 
 		 91 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2824  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 		 92 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.61 
 
 		 103 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.61 
 
 		 103 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  40.79 
 
 		 104 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.54 
 
 		 96 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.42 
 
 		 100 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0821  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.84 
 
 		 103 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1009  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.61 
 
 		 92 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.89 
 
 		 80 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  44.16 
 
 		 106 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  41.77 
 
 		 119 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.24 
 
 		 96 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  41.77 
 
 		 95 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.66 
 
 		 88 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  47.22 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.95 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  42.11 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0972  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.64 
 
 		 105 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.67 
 
 		 84 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  45.07 
 
 		 89 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  45.57 
 
 		 86 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  36.47 
 
 		 94 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.74 
 
 		 103 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  34.21 
 
 		 97 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000538  excinuclease ABC C subunit  38.16 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.559483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0597  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.36 
 
 		 99 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  34.21 
 
 		 96 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  37.33 
 
 		 83 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1011  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.5 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1255  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  41.49 
 
 		 95 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0979  GIY-YIG nuclease superfamily protein  36.36 
 
 		 113 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>