168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2011 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  100 
 
 		 98 aa  203  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  59.76 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  50.55 
 
 		 100 aa  99.4  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  59.49 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.25 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.78 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.15 
 
 		 80 aa  90.5  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.63 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  50 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  48.86 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.95 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.35 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.25 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.15 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  48.75 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.63 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.63 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.63 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.63 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.63 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  43.9 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  43.37 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  43.9 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.57 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  65.96 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  50.75 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  49.33 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.17 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  52.17 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.44 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.17 
 
 		 86 aa  76.6  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  47.95 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.04 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  48.48 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.62 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  42.25 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  45.57 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  36.26 
 
 		 291 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.12 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  46.91 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.31 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  46.15 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.86 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  43.55 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  41.33 
 
 		 295 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  41.33 
 
 		 299 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1200  URI-like endonuclease  44.94 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  36.05 
 
 		 264 aa  67  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  36.78 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.1 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 296 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 110 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.26 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  36.9 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.26 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  38.67 
 
 		 298 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  38.67 
 
 		 304 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  38.67 
 
 		 334 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  38.67 
 
 		 322 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1608  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.98 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  41.98 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  44.44 
 
 		 330 aa  62  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3763  excinuclease ABC subunit C  45.16 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  37.97 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  42.68 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  41.77 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  51.02 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  40.74 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  43.48 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  32.91 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  34.15 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3467  excinuclease ABC subunit C  39.76 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.506637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  39.02 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0247  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.98 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.94 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  34.38 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3661  excinuclease ABC subunit C  46.48 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.902012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.23 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1901  excinuclease ABC subunit C  44.78 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.873761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.75 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.41 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  37.18 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4146  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.11 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.824379  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  34.94 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.94 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  34.94 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.94 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>