46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1696 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1008    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  34.08 
 
 		 514 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  28.61 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1524  hypothetical protein  50 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  43.93 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  27.54 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  27.06 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0862  hypothetical protein  40.3 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  27.81 
 
 		 605 aa  88.2  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  28.7 
 
 		 833 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2428  SH3 type 3 domain protein  35.33 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  23.76 
 
 		 718 aa  73.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2427  hypothetical protein  36.15 
 
 		 615 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  26.6 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  25.84 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  23.38 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  25.55 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  26.6 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  27.37 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  26.64 
 
 		 660 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  25.49 
 
 		 929 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  24.92 
 
 		 625 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  23.65 
 
 		 589 aa  63.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  24.17 
 
 		 528 aa  62  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  25.64 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  24.32 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  21.18 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  25.08 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  26.33 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  33.05 
 
 		 583 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  26.03 
 
 		 1118 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  25.24 
 
 		 1138 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  21.35 
 
 		 913 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  22.49 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  20.67 
 
 		 487 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  22.49 
 
 		 1174 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 		 382 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  34.52 
 
 		 1164 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  32.41 
 
 		 255 aa  47  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  32.41 
 
 		 255 aa  47  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  32.98 
 
 		 346 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  23.28 
 
 		 1421 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3039  hypothetical protein  23.49 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  31.82 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  30.17 
 
 		 336 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>