216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2882 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 377 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  38.79 
 
 		 368 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  40.63 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  34.44 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  34.86 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  35.28 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  35.28 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  35.28 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  34.83 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  34.44 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  33.03 
 
 		 323 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  35.58 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  34.14 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  35.26 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  35.28 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  35.28 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  36.39 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  34.66 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  33.54 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  32.83 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  34.35 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  34.35 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  34.35 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  34.35 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  34.35 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  32.93 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  34.36 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  31.93 
 
 		 325 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  34.35 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  34.35 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  31.93 
 
 		 320 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  34.34 
 
 		 328 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  33.23 
 
 		 323 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  32.92 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  32.92 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  32.62 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  32.62 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  32.92 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  32.62 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  34.46 
 
 		 325 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  30.86 
 
 		 328 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  31.63 
 
 		 357 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  30.86 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  34.57 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  32.57 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  29.6 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  32.58 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  28.95 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  32.26 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  29.37 
 
 		 329 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  28.48 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  30.57 
 
 		 311 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  27.48 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  29.37 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  29.64 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  29.84 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  31.95 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  27.96 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  31.46 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  31.3 
 
 		 327 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  31.92 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  25.81 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  28.43 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  31.31 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  27.59 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  31.31 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  32.47 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  30.92 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  31.43 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  30.84 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  30.84 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  30.84 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  30.84 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.73 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  32.96 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  27.62 
 
 		 329 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.53 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  24.42 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  30.95 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  30.05 
 
 		 307 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  30.26 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.53 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  27.21 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.66 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  28.67 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  32.52 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  25.6 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  25.85 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  27.22 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.19 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  28.17 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  24.66 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  29.75 
 
 		 433 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  27.64 
 
 		 602 aa  106  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  24.73 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  25.33 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  29.53 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  26.2 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>