More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0034 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0034  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
366 aa  731    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430989  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1757  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  83.93 
 
 
368 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.279868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0899  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  79.45 
 
 
368 aa  585  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.32 
 
 
357 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.5 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.45 
 
 
357 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.07 
 
 
363 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.63 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.75 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.63 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.06 
 
 
347 aa  401  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.46 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.01 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.23 
 
 
368 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.34 
 
 
353 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.42 
 
 
355 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.95 
 
 
357 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.77 
 
 
345 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.41 
 
 
356 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.27 
 
 
357 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.87 
 
 
357 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.29 
 
 
355 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.11 
 
 
357 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1836  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.53 
 
 
349 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.35 
 
 
357 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.53 
 
 
355 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.12 
 
 
355 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.43 
 
 
357 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.43 
 
 
356 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.77 
 
 
348 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.29 
 
 
359 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.29 
 
 
355 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.88 
 
 
341 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.94 
 
 
348 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.65 
 
 
348 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.52 
 
 
357 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.27 
 
 
357 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.7 
 
 
346 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.83 
 
 
356 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  55.65 
 
 
802 aa  369  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.03 
 
 
358 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.85 
 
 
353 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3066  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.59 
 
 
348 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.89 
 
 
369 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
346 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3926  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.18 
 
 
348 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.75 
 
 
379 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.4 
 
 
358 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.43 
 
 
350 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.65 
 
 
345 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.96 
 
 
349 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.65 
 
 
352 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.55 
 
 
352 aa  362  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.2 
 
 
346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.47 
 
 
351 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.39 
 
 
348 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.97 
 
 
352 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.1 
 
 
346 aa  359  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.17 
 
 
348 aa  359  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.18 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.14 
 
 
359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.39 
 
 
352 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.8 
 
 
352 aa  355  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.63 
 
 
348 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.55 
 
 
350 aa  355  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.09 
 
 
352 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.09 
 
 
352 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.75 
 
 
348 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.09 
 
 
352 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.14 
 
 
349 aa  354  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1465  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.48 
 
 
346 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.3 
 
 
353 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.8 
 
 
348 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.34 
 
 
348 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.12 
 
 
350 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.55 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.75 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  55.49 
 
 
1237 aa  353  2.9999999999999997e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.6 
 
 
410 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.93 
 
 
349 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.42 
 
 
346 aa  352  8e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.91 
 
 
363 aa  351  8.999999999999999e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.98 
 
 
345 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.2 
 
 
352 aa  351  8.999999999999999e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.47 
 
 
345 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.24 
 
 
349 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.01 
 
 
346 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.49 
 
 
345 aa  350  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.26 
 
 
345 aa  349  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2537  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.88 
 
 
356 aa  349  5e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0235  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.91 
 
 
363 aa  349  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.356948  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.22 
 
 
352 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.02 
 
 
351 aa  348  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.1 
 
 
345 aa  348  8e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.8 
 
 
363 aa  348  8e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.06 
 
 
345 aa  348  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.1 
 
 
345 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.1 
 
 
345 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.43 
 
 
351 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>