114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  100 
 
 
211 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  50 
 
 
206 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  37.07 
 
 
212 aa  118  5e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  38.83 
 
 
201 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 
230 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  41.38 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 
191 aa  91.7  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  33.15 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
227 aa  83.6  2e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  39.86 
 
 
196 aa  82.4  4e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 
213 aa  82.4  5e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  36.11 
 
 
213 aa  81.3  9e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  36.2 
 
 
214 aa  80.5  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  32.62 
 
 
232 aa  80.5  2e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.5 
 
 
243 aa  77  2e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 
216 aa  77  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  31.34 
 
 
210 aa  76.3  3e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  33.86 
 
 
206 aa  75.9  4e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 
192 aa  75.1  7e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  37.43 
 
 
198 aa  73.2  3e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
198 aa  71.6  7e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  6.51262e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  36.42 
 
 
225 aa  70.9  1e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  35.96 
 
 
192 aa  70.1  2e-11  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
230 aa  70.5  2e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  35.48 
 
 
230 aa  67.4  1e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 
182 aa  67.8  1e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  35.5 
 
 
183 aa  66.6  2e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  31.77 
 
 
193 aa  66.2  3e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
187 aa  64.7  9e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
200 aa  61.6  8e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  32.96 
 
 
187 aa  61.2  1e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  27.91 
 
 
197 aa  60.1  2e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
186 aa  60.5  2e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  30.36 
 
 
201 aa  57.4  2e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 
226 aa  54.3  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  46.38 
 
 
196 aa  54.3  1e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
101 aa  53.1  3e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
102 aa  52.8  4e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 
171 aa  51.2  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
233 aa  50.1  2e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  49.7  3e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 
129 aa  49.7  3e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
102 aa  48.9  5e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  40 
 
 
118 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  30.13 
 
 
158 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  52.38 
 
 
280 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
98 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.46838e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
111 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.87166e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.93474e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.41473e-11  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.61335e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.26178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
100 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.13265e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  43.64 
 
 
95 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
106 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
103 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 
95 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.16934e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 
195 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 
121 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 
104 aa  45.1  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  29.11 
 
 
304 aa  45.1  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1366  ArsR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
252 aa  45.1  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00019196  hitchhiker  2.6398e-08 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  43.64 
 
 
114 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  28.76 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  31.37 
 
 
98 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
107 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  38.36 
 
 
123 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
110 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  37.1 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  38.46 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 
109 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  48.08 
 
 
112 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
125 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
115 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  32.2 
 
 
109 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
123 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
119 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 
129 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  51.11 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
88 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
322 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0200  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
99 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0013228  hitchhiker  4.74953e-23 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  32.47 
 
 
306 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
103 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0221  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
99 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  4.66476e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
113 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>