More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05660 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
419 aa  820    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  57.96 
 
 
605 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  54.71 
 
 
535 aa  282  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  51.25 
 
 
659 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  48.38 
 
 
675 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  47.43 
 
 
563 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  51.53 
 
 
528 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  48.09 
 
 
571 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  47.51 
 
 
855 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  50 
 
 
678 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 
776 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
632 aa  232  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  49.82 
 
 
411 aa  232  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  44.7 
 
 
509 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  47.58 
 
 
468 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.06 
 
 
419 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  51.98 
 
 
391 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  46.26 
 
 
525 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  50.18 
 
 
621 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.09 
 
 
521 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  44.78 
 
 
575 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  47.1 
 
 
553 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  51.54 
 
 
638 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 
554 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  48.31 
 
 
695 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 
562 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  47.81 
 
 
470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 
385 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  48.9 
 
 
1029 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.06 
 
 
596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  46.21 
 
 
559 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  50.36 
 
 
673 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  46.07 
 
 
674 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
418 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
766 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  50.37 
 
 
595 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
631 aa  209  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  45.39 
 
 
705 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 
466 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  44.07 
 
 
501 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  43.87 
 
 
525 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  46.77 
 
 
703 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
493 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.52 
 
 
668 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.62 
 
 
531 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.38 
 
 
659 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  40.64 
 
 
487 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  43.07 
 
 
405 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  46.61 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  47.14 
 
 
493 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  51.84 
 
 
575 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  41.07 
 
 
674 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  46.36 
 
 
482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  44.62 
 
 
461 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  49.11 
 
 
507 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 
617 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 
468 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 
543 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.89 
 
 
512 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
564 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.02 
 
 
532 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  41.95 
 
 
460 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  47.09 
 
 
650 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  44.02 
 
 
583 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 
501 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
476 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.56 
 
 
1655 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.25 
 
 
446 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
345 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  47.44 
 
 
581 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 
660 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  39.27 
 
 
557 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 
503 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 
498 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  38.96 
 
 
666 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
721 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  41.25 
 
 
469 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
585 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  30.84 
 
 
638 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 
517 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.09 
 
 
627 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  42.97 
 
 
556 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  33.77 
 
 
625 aa  167  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  39.83 
 
 
612 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
691 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  36.63 
 
 
604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.64 
 
 
579 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.93 
 
 
551 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  33.79 
 
 
692 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.64 
 
 
598 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  42.06 
 
 
621 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.21 
 
 
661 aa  163  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  41.81 
 
 
642 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.45 
 
 
505 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.75 
 
 
584 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  40.09 
 
 
443 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  40.09 
 
 
443 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  40.09 
 
 
443 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>