29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2950 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  81.92 
 
 		 260 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  58.59 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  59.69 
 
 		 260 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  44.36 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  25.69 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  25.49 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  26.95 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  28.12 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  21.82 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  21.95 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  21.07 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  24.6 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  19.12 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  23.7 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  23.41 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  24 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  24.75 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  23.08 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  23.02 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  23.02 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  24 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  22.62 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  21.79 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  21.83 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  23 
 
 		 236 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  24.55 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  22.62 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  21.74 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>