35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1751 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 287 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  93.73 
 
 		 287 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  56.37 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  62.84 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  62.84 
 
 		 335 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  62.84 
 
 		 335 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  51.17 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  52.99 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  46.07 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  49.16 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  42.53 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  36.77 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7234  hypothetical protein  41.04 
 
 		 460 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.273739  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  25.57 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  28.78 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  29.55 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  32.1 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  33.17 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  25.28 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  30.5 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  27.7 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  26.38 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  31.02 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  27.7 
 
 		 525 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  27.04 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  26.42 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  27.4 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  31.07 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2632  TM helix repeat-containing protein  27.54 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.225391  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  23.31 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  30.12 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  20.44 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  26.14 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  25.71 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  23.36 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>