104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2363 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  100 
 
 
365 aa  711    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  45.83 
 
 
363 aa  295  9e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  42 
 
 
329 aa  208  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  39.24 
 
 
306 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  37.28 
 
 
325 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
298 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  37.04 
 
 
304 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
298 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
298 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
298 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  33.05 
 
 
298 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  39.1 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  37.72 
 
 
307 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  34.75 
 
 
293 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  33.14 
 
 
298 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  34.2 
 
 
303 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  36.42 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  36.82 
 
 
313 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  32.76 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  35.57 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  31.69 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  34.99 
 
 
294 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  34.33 
 
 
315 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
339 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
298 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.57 
 
 
336 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
298 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
298 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
298 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
298 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
298 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  37.4 
 
 
302 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  34.38 
 
 
311 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  33.77 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
299 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  33.81 
 
 
295 aa  167  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  33.81 
 
 
317 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  34.3 
 
 
295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  35.04 
 
 
299 aa  166  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  33.72 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  35.59 
 
 
330 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  33.72 
 
 
296 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.04 
 
 
297 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
296 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
327 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  31.97 
 
 
289 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.25 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.75 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  28.77 
 
 
329 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 
294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 
294 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  33.14 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  35.47 
 
 
300 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  34.52 
 
 
640 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  33.05 
 
 
305 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
287 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 
297 aa  136  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  31.99 
 
 
299 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  29.69 
 
 
305 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  29.69 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  29.57 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  52.88 
 
 
120 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  50.44 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.61 
 
 
584 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  45.69 
 
 
302 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  44.83 
 
 
302 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  35.85 
 
 
303 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  52.08 
 
 
299 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  46.55 
 
 
294 aa  99.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  50.44 
 
 
292 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  46.88 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  51.33 
 
 
292 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  25.64 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  29.7 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  29.7 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  29.56 
 
 
418 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  31.33 
 
 
334 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  36 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  23.79 
 
 
420 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
383 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  25.99 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  35 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  35 
 
 
328 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  29.03 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  30 
 
 
357 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  29.66 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  32.18 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  31.25 
 
 
299 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  28.69 
 
 
345 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>