136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2086 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
344 aa  687    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  63.37 
 
 
344 aa  448  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.72 
 
 
530 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.53 
 
 
360 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.93 
 
 
343 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  33.73 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.83 
 
 
356 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  32.83 
 
 
356 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.04 
 
 
366 aa  135  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  32.42 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  34.8 
 
 
245 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.7 
 
 
362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.18 
 
 
357 aa  106  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.51 
 
 
326 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.71 
 
 
349 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.32 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  26.43 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  30.38 
 
 
257 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.43 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  26.07 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.32 
 
 
329 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.43 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.77 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  25.68 
 
 
276 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  27.12 
 
 
334 aa  93.2  7e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  28.21 
 
 
329 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.66 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  26.64 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.29 
 
 
276 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.29 
 
 
276 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  26.86 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  29.23 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.69 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.24 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.24 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  25.28 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.61 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.51 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.66 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.01 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  24.91 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.92 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.71 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  24.91 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.26 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  26.97 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  29.11 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.15 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0682  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.05 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0153413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  27.06 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  25.34 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.61 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.75 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.45 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.3 
 
 
365 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.93 
 
 
261 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  31.67 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  25.45 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  25.88 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  30.25 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.61 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1549  CO dehydrogenase beta subunit/acetyl-CoA synthase epsilon subunit  23.53 
 
 
667 aa  70.5  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  28.46 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  25 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  28.15 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.31 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.3 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  24.76 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.73 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  25.75 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.63 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.63 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.18 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.41 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  24.81 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  26.03 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  25.41 
 
 
247 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.75 
 
 
240 aa  57  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.46 
 
 
275 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.98 
 
 
272 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2611  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.43 
 
 
253 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  26.13 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.29 
 
 
271 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.22 
 
 
343 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34954  predicted protein  27.96 
 
 
260 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629581  normal  0.0447798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>