More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0097 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 470 aa  973    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 		 465 aa  692    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 475 aa  408  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 480 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 485 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 478 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 466 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1108  cysteinyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.917766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 458 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 459 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0061  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.63624  normal  0.0841758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 463 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 461 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 493 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 457 aa  364  1e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 493 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 487 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 462 aa  362  8e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 485 aa  362  9e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 465 aa  362  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 465 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 499 aa  360  3e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 473 aa  360  3e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 460 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 465 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 461 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 501 aa  359  5e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 461 aa  359  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>