216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3080 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  87.09 
 
 		 363 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 363 aa  727    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  87.88 
 
 		 363 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  87.6 
 
 		 363 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  94.78 
 
 		 363 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  92.84 
 
 		 363 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  88.98 
 
 		 364 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  86.5 
 
 		 363 aa  627  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  86.5 
 
 		 363 aa  627  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  86.5 
 
 		 363 aa  627  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  86.5 
 
 		 363 aa  627  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  85.95 
 
 		 363 aa  626  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  85.4 
 
 		 363 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  82.07 
 
 		 366 aa  608  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  80.71 
 
 		 368 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  83.2 
 
 		 363 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  66.22 
 
 		 370 aa  491  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  65.95 
 
 		 370 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  64.82 
 
 		 363 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  64.19 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  64.41 
 
 		 373 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  63.16 
 
 		 361 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  59.73 
 
 		 365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  60.71 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  60.71 
 
 		 369 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  59.39 
 
 		 386 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  60.57 
 
 		 362 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  59.07 
 
 		 371 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  58.79 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  58.79 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  58.52 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  60.52 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  57.14 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  60.52 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  56.63 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  58.67 
 
 		 380 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  58.15 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  57.46 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  55.77 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  57.8 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  54.19 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  52.32 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  52.32 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  54.47 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004166  flagellar P-ring protein FlgI  66.06 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  50.95 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  51.68 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  51.68 
 
 		 367 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  50.27 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  48.77 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  50.56 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  51.41 
 
 		 371 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 370 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  48.07 
 
 		 391 aa  345  8.999999999999999e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  50.85 
 
 		 371 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  49.31 
 
 		 375 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  50.42 
 
 		 371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  50.71 
 
 		 376 aa  342  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  46.69 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  47.77 
 
 		 372 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  51.8 
 
 		 374 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  46.43 
 
 		 368 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  49.29 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  48.36 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  47.93 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0244  flagellar basal body P-ring protein  47.66 
 
 		 387 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  48.2 
 
 		 377 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  47.7 
 
 		 374 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  48.85 
 
 		 377 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  49.31 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  49.04 
 
 		 366 aa  315  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  45.6 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 388 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  47.14 
 
 		 369 aa  311  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.17 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  49.28 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  47.23 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  46.57 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  46.53 
 
 		 373 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  45.12 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  45.12 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  45.12 
 
 		 391 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 		 378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  47.25 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  47.59 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  44.96 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  47.26 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  46.52 
 
 		 394 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  50.15 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.89 
 
 		 390 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  46.52 
 
 		 392 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  46.88 
 
 		 382 aa  301  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  45.6 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  45.96 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  46.86 
 
 		 372 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  46.86 
 
 		 372 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  47.26 
 
 		 371 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>