53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1467 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1467  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  259  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000434659  decreased coverage  0.0000172083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3209  hypothetical protein  77.52 
 
 		 131 aa  208  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000120435  unclonable  0.0000000114703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2790  hypothetical protein  74.6 
 
 		 132 aa  205  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0273206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2555  hypothetical protein  73.6 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1689  hypothetical protein  72.27 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.729509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1620  hypothetical protein  72.27 
 
 		 134 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1695  hypothetical protein  72.27 
 
 		 134 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1913  hypothetical protein  65.62 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1369  hypothetical protein  66.13 
 
 		 135 aa  176  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.741634  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1541  hypothetical protein  64.8 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2817  hypothetical protein  64.8 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2835  hypothetical protein  64.8 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2960  hypothetical protein  64.8 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.946654  normal  0.485074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1729  hypothetical protein  64.34 
 
 		 134 aa  170  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2721  hypothetical protein  63.93 
 
 		 133 aa  167  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1671  hypothetical protein  58.56 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000194021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  26.52 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  25 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  25.98 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  28.18 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  28.72 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  30.3 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  25.74 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  26.24 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  27.1 
 
 		 228 aa  50.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  31.37 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  25.69 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  28.07 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  27.5 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  24.6 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  29.13 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  29.13 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  29.13 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  29.13 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  27.18 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  23.39 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  24.6 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  26.89 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  26.89 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  27.61 
 
 		 246 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  24.58 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1063  lipoprotein  25.74 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3248  lipoprotein  25.44 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  28.04 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>