155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1186 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  40.3 
 
 		 789 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3542  putative phosphoketolase  87.31 
 
 		 788 aa  1483    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  41.93 
 
 		 783 aa  651    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  41.94 
 
 		 812 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  42.62 
 
 		 795 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  41.47 
 
 		 804 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  42.12 
 
 		 807 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  42.11 
 
 		 796 aa  648    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  87.69 
 
 		 788 aa  1477    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  42.09 
 
 		 793 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  41.48 
 
 		 802 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  42.64 
 
 		 800 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  42.95 
 
 		 794 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2965  putative phosphoketolase  86.93 
 
 		 788 aa  1483    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.79462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3047  putative phosphoketolase  86.93 
 
 		 788 aa  1483    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.138192  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  87.18 
 
 		 788 aa  1472    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  42.59 
 
 		 789 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3145  putative phosphoketolase  86.93 
 
 		 788 aa  1480    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.511831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0915  putative phosphoketolase  87.18 
 
 		 788 aa  1469    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0207514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3243  putative phosphoketolase  87.94 
 
 		 788 aa  1488    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1046  putative phosphoketolase  88.07 
 
 		 788 aa  1489    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00195546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  88.2 
 
 		 788 aa  1488    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1051  putative phosphoketolase  87.94 
 
 		 788 aa  1483    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.414026  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  40.9 
 
 		 811 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  41.81 
 
 		 805 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  40.33 
 
 		 792 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  43.07 
 
 		 794 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  41.63 
 
 		 790 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1113  putative phosphoketolase  88.2 
 
 		 788 aa  1492    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0746473  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  40.51 
 
 		 795 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  100 
 
 		 788 aa  1649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1076  putative phosphoketolase  91.88 
 
 		 788 aa  1544    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1147  putative phosphoketolase  88.2 
 
 		 788 aa  1492    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  41.03 
 
 		 811 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  42.49 
 
 		 860 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1282  putative phosphoketolase  93.53 
 
 		 788 aa  1567    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0002253  normal  0.0247047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  41.76 
 
 		 811 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  41.15 
 
 		 791 aa  643    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  41.8 
 
 		 798 aa  647    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  40.85 
 
 		 795 aa  645    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  41.64 
 
 		 811 aa  634  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  41.48 
 
 		 809 aa  634  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  41.64 
 
 		 811 aa  635  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  41.51 
 
 		 795 aa  632  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  40.48 
 
 		 793 aa  629  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  41.32 
 
 		 832 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  41.59 
 
 		 797 aa  625  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  42.17 
 
 		 788 aa  623  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  41.44 
 
 		 791 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  41.44 
 
 		 791 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  41.29 
 
 		 798 aa  624  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  40.4 
 
 		 824 aa  623  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  40.67 
 
 		 823 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  40.68 
 
 		 797 aa  625  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  41.2 
 
 		 800 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  41.32 
 
 		 833 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  40.23 
 
 		 793 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  41.05 
 
 		 835 aa  617  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  41.64 
 
 		 837 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  41.06 
 
 		 800 aa  616  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  40.25 
 
 		 810 aa  616  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  41.51 
 
 		 851 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  40.28 
 
 		 806 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  40.17 
 
 		 823 aa  610  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  40.53 
 
 		 797 aa  612  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  40.6 
 
 		 798 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  40.28 
 
 		 806 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  40.32 
 
 		 832 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  40.15 
 
 		 806 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  40.44 
 
 		 783 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  41.14 
 
 		 787 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  41.12 
 
 		 811 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  41.16 
 
 		 792 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  40.35 
 
 		 800 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  39.35 
 
 		 794 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  39.33 
 
 		 802 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  38.8 
 
 		 821 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  38.82 
 
 		 813 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  39.97 
 
 		 783 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  40.48 
 
 		 832 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  40.85 
 
 		 848 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  40.95 
 
 		 796 aa  592  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  41.67 
 
 		 784 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  41.34 
 
 		 784 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  39.83 
 
 		 820 aa  594  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  39.58 
 
 		 828 aa  595  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  38.33 
 
 		 802 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  38.33 
 
 		 802 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  39.95 
 
 		 802 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  40.77 
 
 		 784 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  39.82 
 
 		 792 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  40.25 
 
 		 782 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  40.35 
 
 		 782 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  39.65 
 
 		 791 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  38.96 
 
 		 797 aa  582  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  38.45 
 
 		 790 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  37.84 
 
 		 834 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  38.85 
 
 		 802 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  38.2 
 
 		 797 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  39.57 
 
 		 835 aa  572  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>