More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0913 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  61.91 
 
 
889 aa  1155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  65.79 
 
 
877 aa  1230  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  100 
 
 
879 aa  1838  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  58.19 
 
 
875 aa  1057  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  65.53 
 
 
877 aa  1237  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  66.21 
 
 
877 aa  1244  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  66.33 
 
 
877 aa  1245  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  65.56 
 
 
918 aa  1228  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  41.44 
 
 
882 aa  653  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  65.68 
 
 
877 aa  1229  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  65.98 
 
 
877 aa  1243  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  42 
 
 
906 aa  684  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  65.3 
 
 
877 aa  1228  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0962  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  45.66 
 
 
871 aa  736  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  65.91 
 
 
877 aa  1231  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  63.6 
 
 
887 aa  1145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  62.6 
 
 
878 aa  1167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  37.99 
 
 
850 aa  493  1e-138  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  36.55 
 
 
855 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  37.68 
 
 
846 aa  466  1e-130  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  36.83 
 
 
855 aa  467  1e-130  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  36.68 
 
 
849 aa  458  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  37.03 
 
 
848 aa  459  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  35.61 
 
 
861 aa  458  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  38.37 
 
 
853 aa  452  1e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00664e-06 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  38.04 
 
 
850 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  31.53 
 
 
848 aa  449  1e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  35.18 
 
 
863 aa  445  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  38.47 
 
 
865 aa  441  1e-122  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  36.6 
 
 
853 aa  436  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  37.08 
 
 
889 aa  436  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  32.9 
 
 
851 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  34.24 
 
 
853 aa  432  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  36.51 
 
 
869 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  33.98 
 
 
867 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  33.98 
 
 
867 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  35.79 
 
 
862 aa  425  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  36.49 
 
 
868 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  34.17 
 
 
876 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  33.98 
 
 
867 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  35.84 
 
 
862 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  35.05 
 
 
858 aa  418  1e-115  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  32.8 
 
 
852 aa  419  1e-115  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  34.29 
 
 
854 aa  419  1e-115  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  34.42 
 
 
849 aa  416  1e-115  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  33.46 
 
 
856 aa  416  1e-115  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  34.69 
 
 
861 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  31.51 
 
 
853 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  32.01 
 
 
853 aa  411  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  31.89 
 
 
848 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  34.48 
 
 
853 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  36.87 
 
 
868 aa  411  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  34.15 
 
 
860 aa  407  1e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  34.29 
 
 
858 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  1.85174e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  34.01 
 
 
851 aa  405  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  33.17 
 
 
848 aa  402  1e-110  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  35.05 
 
 
874 aa  396  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  33.78 
 
 
871 aa  395  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  35.06 
 
 
862 aa  395  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  33.88 
 
 
887 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  31.54 
 
 
837 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  34.38 
 
 
882 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  30.56 
 
 
869 aa  374  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  30.74 
 
 
882 aa  375  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  36.15 
 
 
838 aa  357  6e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  32.54 
 
 
842 aa  356  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  4.02596e-05 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  31.05 
 
 
892 aa  352  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  30.34 
 
 
857 aa  328  2e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  30.03 
 
 
878 aa  320  7e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  31.39 
 
 
834 aa  313  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  29.44 
 
 
807 aa  298  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  30.4 
 
 
823 aa  294  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.73 
 
 
858 aa  258  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.01 
 
 
854 aa  233  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.27 
 
 
835 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.51 
 
 
830 aa  222  2e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.34 
 
 
869 aa  218  3e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.08 
 
 
852 aa  216  1e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.89 
 
 
857 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.44 
 
 
859 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.8 
 
 
859 aa  211  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.37 
 
 
859 aa  210  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.65 
 
 
882 aa  210  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.76 
 
 
853 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.8 
 
 
785 aa  204  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  29.44 
 
 
870 aa  202  2e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.29 
 
 
877 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.36 
 
 
784 aa  195  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.15 
 
 
778 aa  189  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  34.99 
 
 
881 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  28.93 
 
 
883 aa  189  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  28.74 
 
 
846 aa  179  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.14 
 
 
863 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  28.96 
 
 
849 aa  176  2e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  26.44 
 
 
875 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  31.48 
 
 
895 aa  174  6e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  27.27 
 
 
905 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.66 
 
 
886 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.97 
 
 
913 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.79 
 
 
933 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>