99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0611 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  100 
 
 		 288 aa  598  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  80.14 
 
 		 294 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  76.74 
 
 		 288 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  73.87 
 
 		 287 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  75.36 
 
 		 276 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  74.64 
 
 		 276 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  72.13 
 
 		 287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  72.13 
 
 		 287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  72.13 
 
 		 287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  75 
 
 		 276 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  72.83 
 
 		 276 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  71.48 
 
 		 279 aa  428  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  71.74 
 
 		 276 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  67.71 
 
 		 288 aa  424  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  66.32 
 
 		 289 aa  421  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  67.96 
 
 		 287 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  39.15 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  35.76 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  40.51 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  38.75 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  37.37 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  37.93 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  35.13 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  38.1 
 
 		 288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  34.56 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  34.55 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  33.89 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  34.91 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  34.49 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  39.11 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  37.4 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  35.07 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  35.27 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  33.93 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  35.51 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  32.81 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  33.93 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  32.75 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  31.6 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  34.04 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  32.86 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  32.95 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  31.23 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  34.45 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  32.14 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  32.18 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  31.77 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  33.47 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  35.55 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  35.62 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  28.15 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  33.33 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  34.76 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  33.33 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  29.38 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  29.5 
 
 		 281 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  29.5 
 
 		 281 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  31.54 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  29.12 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  30.74 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  27.75 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  28.63 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  29.61 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  26.95 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  26.95 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  26.95 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  28.2 
 
 		 335 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  28.43 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  25.18 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  24.29 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  25.19 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  37.11 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  33.96 
 
 		 144 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  34.04 
 
 		 141 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  36.76 
 
 		 141 aa  49.3  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 		 142 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  30.34 
 
 		 127 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0535  putative signal peptide protein  30.67 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.186468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  23.77 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  34.94 
 
 		 157 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  38.24 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  32.69 
 
 		 155 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  32.32 
 
 		 130 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  28.87 
 
 		 150 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  31.58 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  38.96 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  36.11 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  30.49 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  33.72 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  34.78 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  32.89 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  33.82 
 
 		 141 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  48.94 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  48.94 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  48.94 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  33.77 
 
 		 133 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  35.29 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  31.65 
 
 		 130 aa  42.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  33.85 
 
 		 154 aa  42.4  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>