261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2841 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  100 
 
 
222 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  65.45 
 
 
220 aa  285  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  61.9 
 
 
222 aa  268  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  60.38 
 
 
223 aa  259  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  60.85 
 
 
220 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  59.01 
 
 
224 aa  257  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  55.92 
 
 
213 aa  243  1e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  58.45 
 
 
224 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  54.34 
 
 
230 aa  238  6e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  52.53 
 
 
221 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  53.88 
 
 
224 aa  234  1e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  54.95 
 
 
225 aa  232  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  55.45 
 
 
225 aa  232  4e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  52.49 
 
 
224 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  51.85 
 
 
225 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  51.83 
 
 
228 aa  221  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  53.59 
 
 
228 aa  220  1e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  50.47 
 
 
230 aa  220  1e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  47.95 
 
 
224 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  49.53 
 
 
231 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  51.67 
 
 
235 aa  215  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  7.19315e-05 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  50.23 
 
 
232 aa  211  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  50 
 
 
254 aa  205  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  45.66 
 
 
222 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  45.05 
 
 
222 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  44.09 
 
 
220 aa  189  3e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  44.71 
 
 
222 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  45.37 
 
 
229 aa  172  3e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  40.28 
 
 
220 aa  164  1e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  42.58 
 
 
215 aa  162  4e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  39.91 
 
 
220 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  39.91 
 
 
220 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  40.38 
 
 
219 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  39.61 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  39.61 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  39.61 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  39.61 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  39.61 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  40.1 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.38081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  39.61 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  39.61 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  39.61 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  39.61 
 
 
221 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  39.13 
 
 
221 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  41.43 
 
 
217 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  38.46 
 
 
221 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  38.46 
 
 
221 aa  154  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  40.95 
 
 
224 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  38.28 
 
 
227 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  39.13 
 
 
215 aa  148  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.26197e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  43.14 
 
 
221 aa  147  1e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  38.76 
 
 
220 aa  147  1e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00527e-08  hitchhiker  1.67844e-14 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  37.68 
 
 
217 aa  141  1e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.38787e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  36.65 
 
 
223 aa  140  2e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  38.28 
 
 
222 aa  140  2e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  37.8 
 
 
222 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  36.15 
 
 
217 aa  138  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  37.32 
 
 
217 aa  137  9e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  37.26 
 
 
221 aa  136  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  34.3 
 
 
219 aa  134  1e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
233 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  38.5 
 
 
219 aa  132  4e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  37.67 
 
 
221 aa  129  4e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  33.18 
 
 
217 aa  126  2e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.30553e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  34.13 
 
 
222 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  35.21 
 
 
232 aa  121  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  34.74 
 
 
221 aa  121  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  35.55 
 
 
233 aa  120  1e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  35.5 
 
 
217 aa  120  2e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  35.94 
 
 
231 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  35.61 
 
 
220 aa  119  4e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  34.93 
 
 
231 aa  118  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 
218 aa  118  8e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 
216 aa  117  1e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  32.86 
 
 
216 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  35.12 
 
 
217 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  36.18 
 
 
217 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  29.19 
 
 
223 aa  115  7e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  32.06 
 
 
218 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  33.97 
 
 
218 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  34.31 
 
 
220 aa  110  1e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  34.93 
 
 
229 aa  111  1e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  34.93 
 
 
229 aa  111  1e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  32.7 
 
 
218 aa  110  1e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 
223 aa  110  2e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  36.36 
 
 
231 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  39.41 
 
 
224 aa  108  8e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  33.71 
 
 
227 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  33.04 
 
 
234 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  33.65 
 
 
217 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.27966e-09 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  33.04 
 
 
234 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  30.92 
 
 
220 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 
220 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  30.19 
 
 
217 aa  104  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  30.77 
 
 
216 aa  104  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  33.49 
 
 
234 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00941  VIC family potassium channel protein  33.78 
 
 
234 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  31.6 
 
 
221 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2069  TrkA-N domain protein  34.66 
 
 
228 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  33.8 
 
 
234 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>