124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1082 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  100 
 
 
121 aa  252  1e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.97126e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  95.87 
 
 
121 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  95.87 
 
 
121 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  95.87 
 
 
121 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  95.87 
 
 
121 aa  243  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  82.64 
 
 
121 aa  220  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  82.64 
 
 
121 aa  220  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  83.19 
 
 
119 aa  216  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  80.99 
 
 
124 aa  215  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  61.54 
 
 
124 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  58.68 
 
 
121 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  57.98 
 
 
128 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  60.83 
 
 
121 aa  164  3e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.4442e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  58.12 
 
 
120 aa  161  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  57.14 
 
 
119 aa  160  4e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  57.14 
 
 
119 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.3 
 
 
119 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.84292e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  56.3 
 
 
119 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  56.3 
 
 
120 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  55.46 
 
 
120 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  56.3 
 
 
119 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  54.62 
 
 
127 aa  154  5e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  52.99 
 
 
122 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  52.94 
 
 
121 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  51.26 
 
 
120 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  49.58 
 
 
120 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  47.06 
 
 
126 aa  127  4e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  46.02 
 
 
126 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.64 
 
 
126 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.87 
 
 
120 aa  116  1e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.52 
 
 
123 aa  115  2e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  48.25 
 
 
117 aa  114  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.66 
 
 
123 aa  112  1e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  37.5 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  48.57 
 
 
113 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  44.55 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  38.05 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.05 
 
 
113 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  34.17 
 
 
128 aa  82.4  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.4 
 
 
113 aa  81.6  3e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  34.96 
 
 
149 aa  81.3  4e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  39.29 
 
 
120 aa  79.7  1e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1693  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  79.7  1e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.86 
 
 
117 aa  78.2  4e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  41.76 
 
 
117 aa  74.7  3e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.03 
 
 
117 aa  72.8  2e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.78 
 
 
118 aa  70.9  6e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  35.29 
 
 
118 aa  70.5  8e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  32.14 
 
 
119 aa  70.5  8e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.19 
 
 
118 aa  70.1  1e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  36 
 
 
114 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  36 
 
 
114 aa  68.6  3e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.27 
 
 
127 aa  68.2  4e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.67 
 
 
117 aa  67.8  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.67 
 
 
117 aa  67.4  6e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  38.3 
 
 
119 aa  67  7e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2742  hypothetical protein  38.3 
 
 
119 aa  67  7e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.76 
 
 
121 aa  67  8e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
123 aa  66.2  1e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.78 
 
 
114 aa  65.5  2e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.78 
 
 
114 aa  65.5  2e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.36 
 
 
114 aa  65.1  3e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.17 
 
 
119 aa  65.1  4e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0697  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  64.3  5e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.895833  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  36.67 
 
 
114 aa  63.5  8e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.56 
 
 
114 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.67 
 
 
114 aa  63.2  1e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  35.56 
 
 
114 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.67 
 
 
114 aa  63.5  1e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.56 
 
 
114 aa  62.8  2e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.36 
 
 
115 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.36 
 
 
114 aa  62.8  2e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.56 
 
 
114 aa  62.8  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.26 
 
 
117 aa  60.5  7e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  31.11 
 
 
114 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  31.11 
 
 
114 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.18 
 
 
116 aa  59.3  2e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.73 
 
 
296 aa  58.9  3e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
252 aa  57.4  6e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.18 
 
 
120 aa  57.4  7e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  32.35 
 
 
117 aa  54.7  4e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.14 
 
 
113 aa  53.9  8e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.14 
 
 
113 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5197  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.88 
 
 
114 aa  52.8  2e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  28.77 
 
 
113 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.77 
 
 
113 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2785  hypothetical protein  37.74 
 
 
114 aa  51.6  4e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  32.86 
 
 
115 aa  50.1  1e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.63 
 
 
240 aa  48.9  2e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  29.73 
 
 
114 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.04 
 
 
124 aa  48.9  2e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.29 
 
 
116 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.29 
 
 
91 aa  48.5  3e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.59 
 
 
119 aa  48.9  3e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.94 
 
 
91 aa  47.8  5e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  22.22 
 
 
128 aa  47  9e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.51 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.82 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.82 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  28.41 
 
 
260 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>