48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2785 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2785  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  228  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5197  protein of unknown function DUF861 cupin_3  93.86 
 
 
114 aa  219  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0821  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.79703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  32.58 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4007  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.18 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  39.62 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  37.18 
 
 
120 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.65 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  29.11 
 
 
260 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  37.18 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.62 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.62 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  39.62 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.62 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.74 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.74 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.66 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.74 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  33.75 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.9 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6639  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.9 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.67 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  35.19 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  34.67 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3024  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.49 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0745  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.74 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.78 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  33.75 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  31.17 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.88 
 
 
121 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.62 
 
 
123 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  35.14 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1042  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.17 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284329  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.61 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  28.38 
 
 
126 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  24.39 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.38 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.86 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3909  hypothetical protein  28.05 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.4 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>