More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0088 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
118 aa  237  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  87.29 
 
 
118 aa  180  5e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  72.27 
 
 
118 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  71.55 
 
 
124 aa  151  3e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  75.86 
 
 
122 aa  134  6e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04968  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  46.55 
 
 
122 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001181  flagellar motor switch protein FliN  48.62 
 
 
123 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4421  flagellar motor switch protein FliN  48.91 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.465417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0627  flagellar motor switch protein FliN  41.24 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0707  flagellar motor switch protein FliN  41.49 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00348203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0238  flagellar switch protein  44.3 
 
 
137 aa  82.4  2e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.137291  normal  0.0537834 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  37.19 
 
 
137 aa  80.9  6e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  37.19 
 
 
137 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  37.19 
 
 
137 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  37.19 
 
 
137 aa  80.5  7e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.02287e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  37.19 
 
 
137 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.12484e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  37.19 
 
 
137 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  37.19 
 
 
137 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3386  surface presentation of antigens (SPOA) protein  40.2 
 
 
123 aa  79.3  2e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0246  lateral flagellar export/assembly protein LfiN  40.2 
 
 
123 aa  79  2e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  36.36 
 
 
142 aa  77.8  5e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
137 aa  76.6  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  39.08 
 
 
139 aa  76.6  1e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
137 aa  76.6  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 
137 aa  76.6  1e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
137 aa  76.6  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
137 aa  76.6  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  36 
 
 
137 aa  76.6  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  44 
 
 
138 aa  76.6  1e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  44 
 
 
137 aa  75.9  2e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  44 
 
 
137 aa  75.5  2e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  41.89 
 
 
188 aa  75.1  3e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  44.59 
 
 
136 aa  75.5  3e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  38.78 
 
 
135 aa  74.3  5e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  36.56 
 
 
154 aa  73.9  6e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  38.37 
 
 
137 aa  74.3  6e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  38.55 
 
 
156 aa  73.2  1e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  39.08 
 
 
132 aa  73.2  1e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  36.56 
 
 
161 aa  73.6  1e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  44.59 
 
 
153 aa  73.2  1e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  40.24 
 
 
148 aa  73.2  1e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  36.56 
 
 
154 aa  72.8  1e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  39.53 
 
 
154 aa  73.2  1e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  36.56 
 
 
154 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  39.53 
 
 
154 aa  72.8  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  41.33 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  41.33 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  35.23 
 
 
103 aa  72.8  2e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  36.56 
 
 
109 aa  72.4  2e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  39.82 
 
 
115 aa  72.4  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  38.37 
 
 
154 aa  71.6  3e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.56 
 
 
346 aa  71.6  3e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  35.56 
 
 
346 aa  71.6  3e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  43.06 
 
 
111 aa  72  3e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  37.23 
 
 
152 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  40 
 
 
147 aa  71.6  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  39 
 
 
124 aa  71.2  4e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  35.48 
 
 
139 aa  71.2  4e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  43.06 
 
 
375 aa  71.6  4e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  39 
 
 
124 aa  71.2  4e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  36.47 
 
 
153 aa  71.2  4e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  39.78 
 
 
124 aa  71.2  5e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  43.16 
 
 
115 aa  71.2  5e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  39.76 
 
 
162 aa  70.5  7e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3592  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.25 
 
 
120 aa  70.5  7e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  39.76 
 
 
162 aa  70.5  7e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  41.25 
 
 
155 aa  70.9  7e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  39.76 
 
 
162 aa  70.5  7e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  39.76 
 
 
163 aa  70.5  8e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  39.76 
 
 
161 aa  70.5  8e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  39.73 
 
 
152 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  36.49 
 
 
175 aa  70.5  8e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  41.89 
 
 
99 aa  70.5  9e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  39.53 
 
 
124 aa  70.1  9e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.05 
 
 
151 aa  70.1  9e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  39.76 
 
 
163 aa  70.1  9e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.23 
 
 
175 aa  70.5  9e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  39.53 
 
 
127 aa  70.1  1e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  42.47 
 
 
226 aa  69.7  1e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  45.45 
 
 
126 aa  69.7  1e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  39.19 
 
 
101 aa  69.7  1e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  38.55 
 
 
124 aa  69.3  1e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  39.19 
 
 
101 aa  69.7  1e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  45.45 
 
 
126 aa  69.7  1e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  38.55 
 
 
165 aa  69.7  1e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  36.25 
 
 
155 aa  70.1  1e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  38.55 
 
 
165 aa  69.7  1e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  45.45 
 
 
131 aa  69.7  1e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 
154 aa  70.1  1e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  38.37 
 
 
124 aa  69.7  1e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  41.89 
 
 
174 aa  69.7  1e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  39.19 
 
 
190 aa  69.7  1e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  45.45 
 
 
126 aa  69.7  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  36.56 
 
 
152 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  33.72 
 
 
103 aa  70.1  1e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  40.79 
 
 
143 aa  70.1  1e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  41.89 
 
 
99 aa  70.1  1e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  45.45 
 
 
126 aa  69.7  1e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  39.45 
 
 
109 aa  68.9  2e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  38.55 
 
 
143 aa  69.3  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>