More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0130 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
149 aa  300  5e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  69.86 
 
 
148 aa  210  4e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  69.18 
 
 
148 aa  209  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  62.84 
 
 
148 aa  200  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  63.09 
 
 
149 aa  196  1e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  61.49 
 
 
148 aa  191  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  62.16 
 
 
148 aa  190  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  59.46 
 
 
148 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  60.14 
 
 
148 aa  187  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 
148 aa  184  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  56.76 
 
 
150 aa  180  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  59.18 
 
 
148 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  56.46 
 
 
151 aa  174  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  53.74 
 
 
149 aa  170  8e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  52.38 
 
 
149 aa  165  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  55.1 
 
 
151 aa  164  3e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  54.05 
 
 
148 aa  164  3e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  55.41 
 
 
148 aa  162  1e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  55.33 
 
 
151 aa  160  5e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  52.03 
 
 
150 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  53.1 
 
 
151 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  53.38 
 
 
153 aa  157  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  56.55 
 
 
151 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  51.35 
 
 
150 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  53.42 
 
 
150 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  52.35 
 
 
150 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  52.38 
 
 
151 aa  150  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  49.67 
 
 
152 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  49.67 
 
 
152 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  49.67 
 
 
152 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  50.33 
 
 
150 aa  146  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  48.32 
 
 
152 aa  145  2e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  48 
 
 
151 aa  145  2e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  47.33 
 
 
151 aa  143  7e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  48.67 
 
 
152 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  44.59 
 
 
157 aa  139  1e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  44.22 
 
 
150 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  42.07 
 
 
151 aa  116  1e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  44.14 
 
 
178 aa  114  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
148 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.17895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
151 aa  112  1e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
148 aa  111  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
148 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.23092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
159 aa  109  1e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  109  1e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
148 aa  108  2e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 
148 aa  108  2e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
151 aa  107  4e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.57053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
151 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  36.99 
 
 
170 aa  107  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
148 aa  106  8e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.08464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  42.34 
 
 
153 aa  106  9e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  38.3 
 
 
191 aa  106  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
171 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.25617e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
146 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
149 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  42.96 
 
 
150 aa  104  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  36.73 
 
 
149 aa  104  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.04 
 
 
149 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
148 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
147 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
148 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
150 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
151 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  5.08651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
151 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.25439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
146 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
146 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
151 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.81135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
149 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
148 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
147 aa  100  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  36.99 
 
 
149 aa  100  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
175 aa  99.8  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  40 
 
 
181 aa  98.2  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.27696e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.03383e-05  hitchhiker  1.47927e-09 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  36.3 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  33.79 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.26689e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.83517e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  39.62 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  9.28974e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  34.9 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>