More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0740 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  100 
 
 
150 aa  285  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  65.07 
 
 
152 aa  170  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
148 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  40 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  40 
 
 
151 aa  105  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  36.55 
 
 
178 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  38.1 
 
 
147 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  40 
 
 
181 aa  100  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  40.48 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  40.48 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.23 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  39.68 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  39.68 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  39.68 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  39.68 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  39.68 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  39.68 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  39.68 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 
148 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
151 aa  94  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  33.11 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  34.31 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  33.33 
 
 
191 aa  92  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
147 aa  92  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  30.87 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  31.72 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  29.25 
 
 
171 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  29.93 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  31.29 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  28.97 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  33.58 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  38.52 
 
 
148 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  38.52 
 
 
148 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  35.56 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  31.51 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  32.45 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  32.43 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
149 aa  87  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
148 aa  87.4  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  36.81 
 
 
151 aa  87  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
154 aa  87  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  31.29 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  34.46 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  31.97 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  29.93 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  30.34 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  30.26 
 
 
149 aa  84.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  37.24 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  32.87 
 
 
150 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  30.41 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  29.93 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  36.24 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  28.77 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  28.38 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  24.83 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  28.57 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  31.76 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  26.53 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  30.61 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  30.61 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  30.67 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  32.67 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  34.25 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  26.53 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  35.66 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  31.97 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>