271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4198 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  100 
 
 
94 aa  188  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  57.45 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  56.99 
 
 
94 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  57.83 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  44.57 
 
 
92 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  48.24 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  50.56 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  44.68 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  47.95 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  47.37 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  51.52 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  45.35 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  48.24 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  45.57 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  52.24 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  42.17 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  50 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  52 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  54.84 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  45.74 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  45.88 
 
 
94 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  42.55 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  47.89 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  50 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  45 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  39.33 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  43.02 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  46.51 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  42.7 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  45.95 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  45.68 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  43.02 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  46.99 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  45.33 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  47.95 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  43.42 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  47.56 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  47.3 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  42.55 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  40.23 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  41.49 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  45.98 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  42.35 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  39.13 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  48.57 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  43.24 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  43.24 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  45.45 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  48.65 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  36.67 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  36.67 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  41.77 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  43.28 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  38.55 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  43.28 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  45.98 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  40.74 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  47.22 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0405  acylphosphatase  36.36 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  46.84 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  40.48 
 
 
95 aa  60.5  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  44.74 
 
 
93 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  47.69 
 
 
92 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  38.04 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  39.78 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  36.9 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  50 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  44.44 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1865  acylphosphatase  42.11 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  45.57 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  44.29 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  40.91 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  39.29 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  44.93 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  36.62 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1294  acylphosphatase  49.23 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  47.76 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  33.71 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  44.74 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  40 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  33.7 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  45.31 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  34.83 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  49.23 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  44.93 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  48.1 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  34.48 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  39.29 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  42.11 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  35.71 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  43.84 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  41.54 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  45.71 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  40.48 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  38.24 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  41.38 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  36.11 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  40.74 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  37.8 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  37.8 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>