153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3394 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  82.71 
 
 		 213 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  81.31 
 
 		 213 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  65.89 
 
 		 214 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  65.42 
 
 		 214 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  57.01 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  56.07 
 
 		 214 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  56.07 
 
 		 218 aa  251  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  56.07 
 
 		 214 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  56.54 
 
 		 215 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  55.14 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  55.61 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  53.27 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0776  hypothetical protein  54.67 
 
 		 213 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  50.95 
 
 		 390 aa  221  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  49.3 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0842  hypothetical protein  45.33 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  34.76 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  32.86 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  33.65 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  33.65 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  32.38 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  31.43 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  31.43 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  31.9 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  31.43 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  31.9 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  31.9 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  31.43 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  34.93 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  31.6 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  31.43 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  31.13 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  31.13 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  33.95 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  33.8 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  30.95 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  33.02 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  33.02 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  33.97 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  33.18 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  31.13 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  33.97 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  32.09 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  32.09 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  31.63 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  31.78 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  33.02 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  31.55 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  33.02 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  31.55 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  31.02 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  32.86 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  29.3 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  29.05 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  30.39 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  31.07 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  26.21 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  26.7 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  27.18 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  34.12 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  33 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  27.18 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  27.14 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  31.9 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  29.61 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  26.21 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  29.05 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  29.77 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  26.21 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  29.06 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  24.76 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  29.95 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  28.99 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  29.52 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  28.77 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  28.44 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  29.19 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  29.3 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  29.47 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0054  Putitive phosphate transport regulator  30.73 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  31.1 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  30.43 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  29.91 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  27.54 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  28.16 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  28.64 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  30.1 
 
 		 282 aa  88.2  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  28.5 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  26.89 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>