More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0484 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  100 
 
 		 364 aa  754    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  66.03 
 
 		 362 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  57.8 
 
 		 372 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  57.72 
 
 		 372 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  55.37 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  50.86 
 
 		 355 aa  358  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  48.03 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  46.81 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  51.28 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  44.92 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  44.92 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.58 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.58 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  45.61 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.73 
 
 		 382 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.6 
 
 		 390 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.91 
 
 		 367 aa  318  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  45.61 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.03 
 
 		 366 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  45.01 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.5 
 
 		 386 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.36 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.91 
 
 		 366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.16 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  44.73 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  43.87 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.87 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  43.94 
 
 		 380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  43.66 
 
 		 381 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  43.66 
 
 		 380 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.79 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  44.19 
 
 		 366 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  43.1 
 
 		 380 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  43.1 
 
 		 380 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  43.1 
 
 		 380 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  43.1 
 
 		 381 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  44.57 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  41.76 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  43.38 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.66 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.49 
 
 		 363 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.22 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  43.56 
 
 		 394 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  42.82 
 
 		 379 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  39.74 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.56 
 
 		 414 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.46 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.83 
 
 		 381 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.18 
 
 		 375 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.7 
 
 		 375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  39 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.62 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.13 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.29 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.6 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.68 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.39 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.68 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  40.06 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.51 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  38.18 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.18 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  38.08 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.23 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.18 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.24 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  36.55 
 
 		 606 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  36.55 
 
 		 606 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  35.94 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.24 
 
 		 407 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.13 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.12 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  34.1 
 
 		 585 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  34.9 
 
 		 662 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.39 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  32.65 
 
 		 605 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  30.31 
 
 		 627 aa  179  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.25 
 
 		 702 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  32.35 
 
 		 605 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.07 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  30 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.96 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.9 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  33.52 
 
 		 625 aa  167  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.86 
 
 		 669 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.87 
 
 		 585 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  28.18 
 
 		 597 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.21 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.21 
 
 		 323 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.21 
 
 		 323 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.21 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.92 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.77 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.77 
 
 		 688 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.35 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  27.2 
 
 		 670 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.06 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.03 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.03 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.03 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>