More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1339 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  100 
 
 
253 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  50.79 
 
 
313 aa  244  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  48.8 
 
 
253 aa  241  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  54.07 
 
 
261 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  49 
 
 
254 aa  239  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  53.5 
 
 
262 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  47.18 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  50.2 
 
 
274 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  48.21 
 
 
264 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  48.21 
 
 
264 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  48.8 
 
 
250 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  47.6 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  47.6 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  52.48 
 
 
261 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  48.4 
 
 
250 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  47.58 
 
 
253 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  47.58 
 
 
253 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  47.58 
 
 
253 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  47.58 
 
 
253 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  50.79 
 
 
279 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  50.79 
 
 
279 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  49.6 
 
 
266 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  46.8 
 
 
253 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  50.4 
 
 
279 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  47.77 
 
 
254 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  48.8 
 
 
250 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  49.21 
 
 
266 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  52.07 
 
 
261 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  52.87 
 
 
279 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  49.21 
 
 
266 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  52.07 
 
 
261 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  48.39 
 
 
253 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  47.79 
 
 
253 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  48.79 
 
 
253 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  50 
 
 
268 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  50.79 
 
 
268 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  44.94 
 
 
255 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  50 
 
 
268 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  53.09 
 
 
253 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  48.58 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  47.18 
 
 
253 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  48.41 
 
 
268 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  47.2 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2706  glutamine amidotransferase  47.6 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  47.7 
 
 
247 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2929  glutamine amidotransferase, class I  56.56 
 
 
264 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1670  glutamine amidotransferase, class I  56.56 
 
 
264 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.661584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  56.56 
 
 
264 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0655  glutamine amidotransferase, class I  56.56 
 
 
263 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2655  glutamine amidotransferase, class I  56.11 
 
 
263 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2789  glutamine amidotransferase, class I  55.66 
 
 
349 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  46.8 
 
 
257 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2712  glutamine amidotransferase, class I  55.66 
 
 
264 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.840188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  47.74 
 
 
249 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  47.2 
 
 
257 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1827  glutamine amidotransferase, class I  52.59 
 
 
263 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  46.59 
 
 
255 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  44.05 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  46.09 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1298  peptidase C26  42.91 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.561811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  45.68 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  41.95 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  46.67 
 
 
255 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  47.43 
 
 
254 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  41.74 
 
 
269 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  41.74 
 
 
269 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  42.15 
 
 
269 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  41.32 
 
 
269 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  46.43 
 
 
256 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  43.21 
 
 
259 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  46.56 
 
 
256 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  46.99 
 
 
267 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  42.57 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  43.95 
 
 
275 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  40.74 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  40.74 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  43.2 
 
 
255 aa  171  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  42.74 
 
 
246 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  40.16 
 
 
253 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  43.21 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  40.33 
 
 
254 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  40.33 
 
 
254 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  40.33 
 
 
254 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  40.33 
 
 
254 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  40.33 
 
 
250 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  40.33 
 
 
250 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.343934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  39.92 
 
 
254 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  39.92 
 
 
254 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  43.69 
 
 
264 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4065  peptidase C26  37.69 
 
 
267 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.641789  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  36.84 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3803  peptidase C26  37.6 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2762  peptidase C26  38.62 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126803  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5047  peptidase C26  40.25 
 
 
301 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  37.3 
 
 
254 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1649  peptidase C26  37.92 
 
 
267 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4584  putative gamma-glutamyl hydrolase family protein  36.76 
 
 
256 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7781  peptidase C26  38.33 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  39.68 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  36.36 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.272698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>