More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2526 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
350 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  42.82 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  34.58 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  36.7 
 
 
656 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.23 
 
 
604 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.14 
 
 
114 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.02 
 
 
105 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.52 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.78 
 
 
106 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.31 
 
 
367 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.07 
 
 
649 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  35.79 
 
 
103 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.87 
 
 
105 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 
137 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.23 
 
 
106 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2671  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 
104 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.506336  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  33.98 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
102 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.68 
 
 
107 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
100 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  32.29 
 
 
105 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  32.29 
 
 
105 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.29 
 
 
104 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  32.29 
 
 
105 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36 
 
 
101 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.06 
 
 
127 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  32.41 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.61 
 
 
158 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  34.04 
 
 
106 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  30.85 
 
 
102 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.7 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.85 
 
 
102 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4955  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.41 
 
 
108 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519732  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.86 
 
 
285 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  34.41 
 
 
110 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 
521 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  31.25 
 
 
118 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  31.25 
 
 
118 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  29.29 
 
 
289 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.23 
 
 
294 aa  59.7  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  31.25 
 
 
105 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
108 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  35.79 
 
 
120 aa  59.7  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1701  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  36.08 
 
 
132 aa  59.7  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104071  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
108 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124598  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 
116 aa  59.3  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4586  Rieske (2Fe-2S) region  40.54 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872692  normal  0.412492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3746  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
108 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108566  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  30.21 
 
 
105 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
509 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.21 
 
 
110 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  30 
 
 
107 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.65 
 
 
123 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  37.88 
 
 
112 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  28.12 
 
 
104 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.41 
 
 
116 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.25 
 
 
106 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.71 
 
 
112 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1110  anthranilate dioxygenase ferredoxin reductase(AndAb)  29 
 
 
107 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662253  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  30.69 
 
 
119 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0955  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.68 
 
 
112 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  32.91 
 
 
103 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2677  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.25 
 
 
101 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
101 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  25 
 
 
311 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  32.65 
 
 
102 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 
109 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2323  Rieske (2Fe-2S) protein  39.19 
 
 
108 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  26.92 
 
 
102 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33 
 
 
521 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3778  Rieske (2Fe-2S) region  38.36 
 
 
101 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.84 
 
 
296 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1393  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.63 
 
 
117 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.29 
 
 
523 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2106  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  31.86 
 
 
127 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298831  normal  0.595074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.72 
 
 
99 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
100 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.95 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.59 
 
 
111 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0207  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.17 
 
 
105 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
506 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0463  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  35.64 
 
 
131 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.08 
 
 
104 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  32 
 
 
521 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.08 
 
 
104 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2964  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  32.97 
 
 
112 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.09 
 
 
105 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0572  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.65 
 
 
152 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237046  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.54 
 
 
101 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  30.84 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3131  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  34.65 
 
 
131 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.43 
 
 
109 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0740  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.65 
 
 
131 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  30.43 
 
 
109 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  30.43 
 
 
109 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>