More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1469 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  78.97 
 
 
591 aa  937  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  56.24 
 
 
590 aa  684  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  100 
 
 
586 aa  1194  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  51.89 
 
 
589 aa  649  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  55.98 
 
 
588 aa  682  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  49.57 
 
 
586 aa  626  1e-178  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  48.97 
 
 
587 aa  613  1e-174  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  47.82 
 
 
588 aa  577  1e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  47.06 
 
 
584 aa  577  1e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  47 
 
 
619 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  46.48 
 
 
611 aa  567  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.1667e-08  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  46.59 
 
 
611 aa  566  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  47.78 
 
 
600 aa  561  1e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  44.75 
 
 
614 aa  564  1e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  45.53 
 
 
613 aa  558  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
594 aa  542  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  44.6 
 
 
603 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 
608 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  44.31 
 
 
600 aa  512  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 
622 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.15 
 
 
592 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  40.45 
 
 
592 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  38.85 
 
 
616 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  40.54 
 
 
602 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  42.08 
 
 
623 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
603 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  38.13 
 
 
611 aa  466  1e-130  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  36.79 
 
 
635 aa  467  1e-130  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  38.09 
 
 
602 aa  467  1e-130  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  37.46 
 
 
607 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  38.37 
 
 
610 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  39.67 
 
 
625 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  44.44 
 
 
650 aa  447  1e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  39.05 
 
 
588 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.01252e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.8 
 
 
608 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.37 
 
 
614 aa  429  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  39.27 
 
 
587 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  39.27 
 
 
587 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.02 
 
 
587 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.02 
 
 
587 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06018e-05 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.67 
 
 
597 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
587 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  39.02 
 
 
587 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
587 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.47455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.85 
 
 
587 aa  417  1e-115  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.85 
 
 
587 aa  416  1e-115  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.58 
 
 
610 aa  415  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  38.11 
 
 
587 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  38.46 
 
 
617 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  38.99 
 
 
587 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.32 
 
 
617 aa  409  1e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.00526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  36.13 
 
 
597 aa  405  1e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.29 
 
 
598 aa  407  1e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  36.13 
 
 
597 aa  406  1e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  35.68 
 
 
609 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  37.1 
 
 
608 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  42.63 
 
 
610 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  38.46 
 
 
593 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  42.63 
 
 
610 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  37.24 
 
 
602 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  36.43 
 
 
579 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  36.43 
 
 
579 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.84481e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  34.64 
 
 
621 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  36.69 
 
 
594 aa  401  1e-110  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.02 
 
 
581 aa  400  1e-110  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  37.98 
 
 
594 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  37.13 
 
 
578 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  37.13 
 
 
578 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.16 
 
 
597 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  36.32 
 
 
602 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  40.56 
 
 
622 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.71 
 
 
600 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.16 
 
 
589 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.52 
 
 
578 aa  391  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
598 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  36.44 
 
 
637 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.92 
 
 
598 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  38.31 
 
 
626 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  37.62 
 
 
645 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
592 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  36.59 
 
 
626 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.38 
 
 
592 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.94 
 
 
598 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
585 aa  385  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.39 
 
 
598 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  34.2 
 
 
578 aa  385  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.94 
 
 
598 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.59 
 
 
592 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.94 
 
 
598 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  35.94 
 
 
598 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  35.76 
 
 
594 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.89 
 
 
580 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  35.08 
 
 
588 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.19 
 
 
602 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.04 
 
 
598 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
636 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.94 
 
 
598 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.28 
 
 
609 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.04 
 
 
598 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  35.1 
 
 
598 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>