204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  100 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7860  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like protein  55.77 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2750  putative branched-chain amino acid transporter  50.45 
 
 		 228 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2382  AzlC family protein  50.25 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3787  AzlC family protein  49.78 
 
 		 233 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09380  4-azaleucine resistance probable transporter AzlC  49.53 
 
 		 279 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  38.53 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  39.72 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  40.38 
 
 		 319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3255  AzlC family protein  44.83 
 
 		 230 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  33.81 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  37.68 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  33.48 
 
 		 235 aa  122  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  29.41 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3541  AzlC family protein  30.77 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000459518  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  30.14 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  29.65 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  41.29 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1793  branched-chain amino acid permease  34.91 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1188  AzlC family protein  35.78 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  31.13 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  27.71 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3167  AzlC family protein  27.78 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1053  branched chain amino acid ABC transporter  32 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00466043  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2142  AzlC family protein  30.81 
 
 		 236 aa  86.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.457297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  35.93 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  33.33 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  27.84 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  31.87 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.98 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  33.01 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.08 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  30.46 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  29.83 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  27.07 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  27.68 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  32.26 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  27.72 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  29.17 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  26.32 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  31.33 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  30.06 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  28.98 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  29.61 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  30.18 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  24.73 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  26.29 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  31.22 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  29.05 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30.81 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  24.73 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  27.27 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  24.74 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  30.05 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  26.88 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  30.24 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  31.91 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  27.72 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13200  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.44 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.754483 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  27.72 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06980  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  32.58 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000303434  normal  0.415503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  27.05 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  27.05 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  29.51 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  30.57 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  24.88 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  28.36 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  28.36 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1402  AzlC family protein  30.73 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000122963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  27.17 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  28.11 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  28.49 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  28.86 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  28.32 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  28.5 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  28.57 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  28.57 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  27.05 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  27.64 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  27.32 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  27.32 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  27.32 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  29.26 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  27.32 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  29.9 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  27.32 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  25 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  27.32 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  28.65 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.21 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  28.65 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  28.36 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  28.36 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  28.36 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  27.35 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  30.77 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.86 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.36 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.86 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  26.94 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>