150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1053 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1053  branched chain amino acid ABC transporter  100 
 
 		 243 aa  487  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00466043  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1793  branched-chain amino acid permease  45.3 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3541  AzlC family protein  40.62 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000459518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3167  AzlC family protein  39.91 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1930  AzlC family protein  41.44 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2142  AzlC family protein  42.27 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.457297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  31.16 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  28.38 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  30.39 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  34.17 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  28.64 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  30.64 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  32 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7860  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like protein  35.15 
 
 		 264 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1188  AzlC family protein  31.79 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  29.58 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2750  putative branched-chain amino acid transporter  37.8 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  26.18 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  27.96 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  26.74 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  28.5 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3255  AzlC family protein  28.74 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  29.24 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3787  AzlC family protein  34.1 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  28.65 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  30.41 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  32.12 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2382  AzlC family protein  32.92 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0119  AzlC family protein  28.57 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13200  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  24.11 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.754483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.88 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  30.23 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  28.57 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  28.22 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  27.27 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  27.33 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  27.01 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09380  4-azaleucine resistance probable transporter AzlC  30.82 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  26.56 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  27.53 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  26.04 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  26.84 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  27.53 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  26.04 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  26.04 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  26.04 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  26.04 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  26.04 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  23.9 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  26.04 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  28.12 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  26.04 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  26.52 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  24.08 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  29.7 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  29.7 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  29.09 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  27.07 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  28.09 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  29.09 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  27.85 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  26.74 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  29.09 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  29.09 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  21.55 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  26.26 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  26.74 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  25.46 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  27.37 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  26.42 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  28.48 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  25.13 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  23.47 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  26.16 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  28.92 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  26.82 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  26.45 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  25 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  26.82 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  26.82 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  26.67 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  24.88 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1402  AzlC family protein  23.44 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000122963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  25 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  25.58 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06980  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  20.52 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000303434  normal  0.415503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  23.53 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  26.19 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  25.7 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  23.89 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  25 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  24.29 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  25.7 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  25.7 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  25.7 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1458  AzlC family protein  27.21 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  23.96 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  25.7 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  25.7 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  23.97 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>