178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3255 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3255  AzlC family protein  100 
 
 		 230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  44.44 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7860  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like protein  45.89 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2750  putative branched-chain amino acid transporter  45.15 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3787  AzlC family protein  43.89 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2382  AzlC family protein  47.42 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  41.35 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  37.91 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09380  4-azaleucine resistance probable transporter AzlC  46.7 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  34.07 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  29.9 
 
 		 220 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  36.73 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1188  AzlC family protein  33.64 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  32.06 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  28.91 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3541  AzlC family protein  31.5 
 
 		 267 aa  98.2  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000459518  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  28.44 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  29.17 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  26.54 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  30.35 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  36.45 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3167  AzlC family protein  29.67 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1053  branched chain amino acid ABC transporter  26.51 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00466043  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1793  branched-chain amino acid permease  32.78 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1930  AzlC family protein  30.63 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2142  AzlC family protein  26.42 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.457297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  33.54 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  31.44 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  32.03 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  33.13 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3185  AzlC family protein  35.19 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  33.13 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  31.32 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0119  AzlC family protein  25.84 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  30.98 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  32.2 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  32.55 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  28.3 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  28.88 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  29.01 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  28.57 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  31.91 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  31.52 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  27.68 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1458  AzlC family protein  32.61 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  31.02 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  30.77 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  26.75 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  29.36 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4543  AzlC family protein  30.77 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  28.12 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1402  AzlC family protein  26.55 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000122963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13200  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  24.65 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.754483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  28.57 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  26.11 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  26.57 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.27 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.27 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.27 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  24.71 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  27.61 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  27.61 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  27.61 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.27 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.27 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.27 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  27.61 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.27 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  27.07 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.27 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.27 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  29.13 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  27.61 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  27.07 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  27.61 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  27.61 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  29.32 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.27 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2053  AzlC family protein  34.62 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.547201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  30.81 
 
 		 282 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  26.7 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4324  AzlC family protein  30.39 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.238714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4284  azaleucine resistance protein AzlC  30.39 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4436  AzlC family protein  30.39 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4370  AzlC family protein  30.39 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4255  AzlC family protein  30.39 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  32.93 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  27.39 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  32.34 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  30 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  29.52 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  30.6 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  28.57 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4080  AzlC family protein  30.39 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  25.6 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  25.6 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  27.94 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  34.38 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  27.59 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  28.08 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>