62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  47.18 
 
 		 1125 aa  939    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  43.51 
 
 		 1144 aa  920    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  46.88 
 
 		 1133 aa  931    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  43.99 
 
 		 1143 aa  914    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  46.14 
 
 		 1124 aa  934    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  46.77 
 
 		 1123 aa  889    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  44.04 
 
 		 1121 aa  900    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  44.8 
 
 		 1121 aa  905    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  44.19 
 
 		 1122 aa  909    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  44.18 
 
 		 1121 aa  902    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  47.91 
 
 		 1140 aa  965    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  43.92 
 
 		 1125 aa  901    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  44.15 
 
 		 1121 aa  912    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  44.14 
 
 		 1121 aa  896    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  48.06 
 
 		 1130 aa  1019    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  100 
 
 		 1166 aa  2350    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  32.22 
 
 		 1124 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  31.26 
 
 		 1126 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  30.88 
 
 		 1143 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  27.83 
 
 		 1133 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1118 aa  293  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1120 aa  257  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1126 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1118 aa  250  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1120 aa  249  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1120 aa  249  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1128 aa  242  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  25.3 
 
 		 1154 aa  224  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  25.37 
 
 		 1153 aa  216  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1137 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  29.57 
 
 		 1136 aa  205  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  48.22 
 
 		 352 aa  183  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1120 aa  170  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1125 aa  164  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1114 aa  155  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1045 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  23.5 
 
 		 979 aa  144  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1121 aa  139  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1146 aa  124  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1120 aa  118  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  23.64 
 
 		 694 aa  115  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1151 aa  83.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1181 aa  82.4  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  25.2 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25.42 
 
 		 462 aa  77  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  27.5 
 
 		 1207 aa  71.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  24.78 
 
 		 1107 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  27.88 
 
 		 1159 aa  68.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  27.86 
 
 		 1228 aa  62.4  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  26.15 
 
 		 1093 aa  62.4  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  26.12 
 
 		 1109 aa  59.7  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1214 aa  56.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  23.28 
 
 		 1113 aa  54.3  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1141 aa  50.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  28 
 
 		 1140 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0895  hypothetical protein  55.88 
 
 		 54 aa  47.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  29.46 
 
 		 1159 aa  46.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1159 aa  46.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1159 aa  46.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1138 aa  45.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1145 aa  45.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  37.04 
 
 		 604 aa  45.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>