More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2430 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2739  8-amino-7-oxononanoate synthase  86.21 
 
 
401 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2358  8-amino-7-oxononanoate synthase  96.8 
 
 
406 aa  767    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000259598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2430  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
406 aa  819    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2518  aminotransferase, class I and II  93.33 
 
 
406 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000907051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  69.78 
 
 
403 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1752  8-amino-7-oxononanoate synthase  72.21 
 
 
406 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1759  8-amino-7-oxononanoate synthase  71.46 
 
 
406 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2526  8-amino-7-oxononanoate synthase  71.46 
 
 
406 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1796  8-amino-7-oxononanoate synthase  70.97 
 
 
412 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0638776  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.34 
 
 
396 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.95 
 
 
400 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1802  aminotransferase class I and II  57.36 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.66 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1720  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.61 
 
 
382 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0359969  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1659  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.91 
 
 
406 aa  354  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1439  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.65 
 
 
385 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00843226  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.13 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.88 
 
 
385 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.24 
 
 
392 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.23 
 
 
410 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.15 
 
 
385 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.51 
 
 
397 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.58 
 
 
383 aa  282  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.88 
 
 
389 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.36 
 
 
390 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.37 
 
 
403 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.9 
 
 
401 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.98 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.43 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.39 
 
 
386 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.98 
 
 
401 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.09 
 
 
396 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.6 
 
 
390 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.6 
 
 
392 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.43 
 
 
386 aa  269  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.58 
 
 
384 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.31 
 
 
383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.55 
 
 
396 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.63 
 
 
390 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.71 
 
 
397 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
391 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.73 
 
 
383 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.94 
 
 
391 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.26 
 
 
396 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.17 
 
 
387 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.36 
 
 
390 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.1 
 
 
394 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.78 
 
 
391 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.61 
 
 
384 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2930  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.11 
 
 
383 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2843  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.11 
 
 
383 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.22 
 
 
384 aa  256  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.51 
 
 
384 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1312  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.68 
 
 
383 aa  256  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.63 
 
 
384 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.7 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.93 
 
 
384 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  44.93 
 
 
384 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.93 
 
 
384 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1426  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.72 
 
 
383 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 
385 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.93 
 
 
384 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.26 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.64 
 
 
384 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 
385 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.37 
 
 
389 aa  253  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 
385 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02210  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.8 
 
 
466 aa  252  8.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63523  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.74 
 
 
387 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.47 
 
 
385 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  42.77 
 
 
382 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.76 
 
 
391 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.64 
 
 
384 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.9 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.61 
 
 
392 aa  242  7.999999999999999e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.03 
 
 
391 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.6 
 
 
396 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.7 
 
 
384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.45 
 
 
387 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.65 
 
 
410 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.18 
 
 
395 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.25 
 
 
391 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.94 
 
 
408 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02875  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.25 
 
 
379 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.21 
 
 
399 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
393 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.21 
 
 
389 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.21 
 
 
389 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.84 
 
 
393 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.7 
 
 
393 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.15 
 
 
390 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.41 
 
 
390 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.76 
 
 
395 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.09 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.9 
 
 
410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0027  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.15 
 
 
388 aa  225  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.87483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.59 
 
 
395 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1429  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.6 
 
 
380 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.59 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.15 
 
 
405 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>