74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0836 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  90.86 
 
 		 197 aa  380  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  91.37 
 
 		 201 aa  380  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  91.37 
 
 		 201 aa  380  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  90.86 
 
 		 201 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  88.83 
 
 		 197 aa  373  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  89.34 
 
 		 201 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  89.34 
 
 		 201 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  89.34 
 
 		 201 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  88.83 
 
 		 201 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  88.83 
 
 		 201 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  88.83 
 
 		 201 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  88.32 
 
 		 201 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  88.83 
 
 		 197 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  87.31 
 
 		 201 aa  367  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  85.28 
 
 		 201 aa  360  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  65.99 
 
 		 196 aa  271  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  63.96 
 
 		 196 aa  265  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  64.5 
 
 		 200 aa  262  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  63.87 
 
 		 195 aa  261  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  67.42 
 
 		 196 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  53.12 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  47.64 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  43.32 
 
 		 196 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  42.47 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  47.09 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  42.78 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  46.51 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  46.51 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  43.6 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0713  hypothetical protein  31.09 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0189  hypothetical protein  31.28 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  29.44 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1310  hypothetical protein  25.52 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0063  hypothetical protein  28.72 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1832  hypothetical protein  27.59 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2333  hypothetical protein  25.91 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000127187  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1635  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.04 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00120258  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  27.36 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1283  hypothetical protein  27.73 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1321  hypothetical protein  27.73 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  hitchhiker  0.00000388777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1978  hypothetical protein  27.73 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1306  hypothetical protein  27.73 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123286  hitchhiker  0.000000111415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2162  hypothetical protein  27.73 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000341487 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01109  hypothetical protein  22.83 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2218  putative lipoprotein  22.83 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1485  putative lipoprotein  22.83 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.757345  hitchhiker  0.0000742206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2542  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.83 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00786128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01101  predicted outer membrane lipoprotein  22.83 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2021  putative lipoprotein  22.83 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  hitchhiker  0.0000702236 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2496  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.83 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000260622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1620  fibronectin-binding protein B  26.89 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0791942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1228  putative lipoprotein  22.83 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0969231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1227  putative lipoprotein  22.83 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000200273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  29.13 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1490  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.84 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1698  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.52 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1590  putative lipoprotein  27.52 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228931  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2816  putative lipoprotein  27.52 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1219  hypothetical protein  24.34 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0427  hypothetical protein  25.74 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2792  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1604  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.79 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1922  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.79 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.939521  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.43 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2796  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.58 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2490  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.58 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4205  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  25.12 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  24.77 
 
 		 332 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  29.85 
 
 		 312 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  27.69 
 
 		 340 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>