20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2792 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2792  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  34.15 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  32 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  33.8 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  37.42 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.5 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  27.23 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  35.16 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.08 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  27.54 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.57 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  26.6 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  28.02 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  27.59 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.09 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  28.14 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1490  hypothetical protein  30.15 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.25 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>