45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1313 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  85.71 
 
 		 196 aa  346  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  59.31 
 
 		 204 aa  231  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  57.95 
 
 		 195 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  53.55 
 
 		 205 aa  186  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  44.72 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  44.22 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  44.22 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  44.22 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  47.34 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  43.72 
 
 		 201 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  43.72 
 
 		 201 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  43.72 
 
 		 201 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  45.31 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  43.22 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  44.79 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  42.21 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  43.32 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  43.22 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  42.71 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  46.77 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  41.71 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  40.74 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  42.41 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  45.7 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  45.7 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  47.67 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  39.26 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  38.65 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  37.42 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0713  hypothetical protein  31.41 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0189  hypothetical protein  29.95 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0063  hypothetical protein  29.9 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2333  hypothetical protein  28.65 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000127187  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1310  hypothetical protein  26.46 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1219  hypothetical protein  27.18 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1490  hypothetical protein  26.15 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1832  hypothetical protein  31.03 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  26.74 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  30.97 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.58 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.13 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  26.29 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>