More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2139 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.80024e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  4.54991e-10  decreased coverage  3.24957e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.73e-08  unclonable  4.74923e-06 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.15255e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  98.39 
 
 
186 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.05635e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  91.35 
 
 
186 aa  355  2e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.4351e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  91.4 
 
 
186 aa  355  2e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  88.71 
 
 
186 aa  350  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  88.71 
 
 
186 aa  350  9e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  89.73 
 
 
186 aa  350  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.20633e-06  unclonable  1.67912e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  95.7 
 
 
186 aa  348  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  95.16 
 
 
186 aa  347  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.41842e-07  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  95.16 
 
 
186 aa  347  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.35391e-10  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  95.16 
 
 
186 aa  347  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  8.86645e-07  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  87.03 
 
 
186 aa  341  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  7.74708e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  83.96 
 
 
188 aa  327  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.09401e-06  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  60.54 
 
 
189 aa  253  1e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  60.22 
 
 
188 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  60.22 
 
 
188 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  62.9 
 
 
184 aa  245  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  60.75 
 
 
185 aa  244  5e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  62.9 
 
 
184 aa  243  1e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  60.22 
 
 
185 aa  243  1e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  58.92 
 
 
188 aa  243  1e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  62.9 
 
 
184 aa  243  1e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  61.83 
 
 
186 aa  241  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  60.22 
 
 
185 aa  241  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  62.9 
 
 
184 aa  240  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  62.37 
 
 
184 aa  238  3e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  61.83 
 
 
184 aa  237  6e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  60.75 
 
 
184 aa  236  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  60.22 
 
 
184 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  59.68 
 
 
199 aa  235  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  59.68 
 
 
185 aa  234  5e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  61.29 
 
 
184 aa  234  5e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  59.68 
 
 
184 aa  233  1e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  59.14 
 
 
186 aa  232  2e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  59.68 
 
 
185 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  59.68 
 
 
185 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  59.68 
 
 
185 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  59.68 
 
 
185 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  59.68 
 
 
185 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  59.68 
 
 
185 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  59.68 
 
 
185 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  58.6 
 
 
185 aa  230  7e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  59.14 
 
 
185 aa  230  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  59.68 
 
 
188 aa  230  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  56.99 
 
 
185 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  57.53 
 
 
185 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  59.14 
 
 
186 aa  228  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  56.99 
 
 
185 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  57.53 
 
 
185 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  56.99 
 
 
185 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  56.99 
 
 
185 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  56.99 
 
 
185 aa  225  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  55.91 
 
 
185 aa  224  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  56.99 
 
 
186 aa  221  5e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  55.91 
 
 
186 aa  218  4e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  54.59 
 
 
190 aa  217  9e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  50.54 
 
 
189 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  50.54 
 
 
189 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  52.49 
 
 
189 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  8.67749e-07  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  50.54 
 
 
189 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  50.54 
 
 
189 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  51.93 
 
 
189 aa  199  2e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  51.38 
 
 
189 aa  198  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  50 
 
 
189 aa  197  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  50.26 
 
 
191 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  50.26 
 
 
191 aa  184  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  42.63 
 
 
190 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  40.53 
 
 
191 aa  140  1e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  36.41 
 
 
188 aa  130  1e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  36.41 
 
 
188 aa  130  1e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  36.41 
 
 
188 aa  130  1e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  129  2e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  35.83 
 
 
187 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  40.11 
 
 
185 aa  128  5e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  36.96 
 
 
188 aa  127  1e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  1e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  1e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  37.43 
 
 
187 aa  127  1e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  1e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  35.68 
 
 
188 aa  127  1e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  35.68 
 
 
188 aa  127  1e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  1e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  1e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  36.96 
 
 
188 aa  127  1e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  36.46 
 
 
190 aa  125  4e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  37.1 
 
 
185 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  7.99114e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  35.33 
 
 
213 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  36.9 
 
 
211 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  35.14 
 
 
188 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>