50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  100 
 
 
265 aa  544  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  49.55 
 
 
270 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  48.46 
 
 
270 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  49.55 
 
 
271 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  49.1 
 
 
271 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  49.1 
 
 
271 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  51.92 
 
 
270 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  46.09 
 
 
262 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  44.95 
 
 
255 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  50.46 
 
 
281 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  44.04 
 
 
260 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  47.14 
 
 
270 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  44.04 
 
 
260 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  43.58 
 
 
260 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  44.04 
 
 
260 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  44.04 
 
 
260 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  44.04 
 
 
260 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  44.04 
 
 
260 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  43.58 
 
 
260 aa  184  1e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  44.84 
 
 
254 aa  184  1e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  45.33 
 
 
254 aa  184  2e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  43.12 
 
 
260 aa  183  2e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  41.3 
 
 
258 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  52.69 
 
 
271 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  45.28 
 
 
273 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  47.71 
 
 
262 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  39.45 
 
 
259 aa  175  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  4.8698e-06 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  37.4 
 
 
263 aa  172  4e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  40.54 
 
 
258 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  44.44 
 
 
263 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  39.27 
 
 
259 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  44.1 
 
 
237 aa  166  3e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  44.09 
 
 
263 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  34.94 
 
 
260 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  42.08 
 
 
270 aa  159  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  31.42 
 
 
248 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  35.57 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  35.46 
 
 
321 aa  79  7e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  35 
 
 
258 aa  75.1  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  36.88 
 
 
256 aa  72.4  7e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  29.31 
 
 
278 aa  67.4  2e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  27.23 
 
 
280 aa  66.2  5e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  28.29 
 
 
358 aa  64.3  2e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  33.79 
 
 
246 aa  56.6  4e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  26.71 
 
 
216 aa  54.3  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  32.58 
 
 
254 aa  52.8  6e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  31.87 
 
 
356 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  27.47 
 
 
364 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  35.16 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0574  hypothetical protein  32.18 
 
 
358 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>