More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3643 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  100 
 
 		 392 aa  794    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  59.51 
 
 		 383 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  58.7 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  50.4 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  48.08 
 
 		 372 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.99 
 
 		 373 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  46.52 
 
 		 384 aa  338  8e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  48.53 
 
 		 373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  48.12 
 
 		 373 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.26 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  48.26 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  46.92 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  50.67 
 
 		 373 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  50.67 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  47.44 
 
 		 378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  47.24 
 
 		 378 aa  322  7e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  46.26 
 
 		 376 aa  319  6e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  48.79 
 
 		 373 aa  318  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  47.7 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  47.44 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  47.81 
 
 		 368 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  43.05 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  48.49 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  47.3 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  45.7 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  47.38 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  44.71 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  45.97 
 
 		 372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  44.89 
 
 		 375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  46.4 
 
 		 390 aa  312  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  46.3 
 
 		 375 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  46.99 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  46.65 
 
 		 373 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  45.97 
 
 		 374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  45.63 
 
 		 376 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  47.31 
 
 		 372 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  43.97 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  46.11 
 
 		 382 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  48 
 
 		 372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  44.5 
 
 		 379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  47.31 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  47.58 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  46.51 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  46.51 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  43.7 
 
 		 373 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  46.24 
 
 		 372 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  46.24 
 
 		 372 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  45.97 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 		 374 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  47.8 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  45.97 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  43.92 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  45.65 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  44.8 
 
 		 376 aa  293  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 		 370 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  45.53 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  45.53 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  43.6 
 
 		 378 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  44.44 
 
 		 367 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  46.17 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  45.04 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 		 372 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  44.81 
 
 		 378 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 		 374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  44.29 
 
 		 373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  45.63 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  43.55 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  43.48 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  41.98 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  45.43 
 
 		 374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  45.5 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  45.36 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  44.27 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  43.73 
 
 		 379 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  44.27 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>